Protein–RNA interactions for Protein: Q99KK1

Reep3, Receptor expression-enhancing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Reep3Q99KK1 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Reep3Q99KK1 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Reep3Q99KK1 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Reep3Q99KK1 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Reep3Q99KK1 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Reep3Q99KK1 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Reep3Q99KK1 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Reep3Q99KK1 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Reep3Q99KK1 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Reep3Q99KK1 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Reep3Q99KK1 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Reep3Q99KK1 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Reep3Q99KK1 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Reep3Q99KK1 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Reep3Q99KK1 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Reep3Q99KK1 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Reep3Q99KK1 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Reep3Q99KK1 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Reep3Q99KK1 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Reep3Q99KK1 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Reep3Q99KK1 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Reep3Q99KK1 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Reep3Q99KK1 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Reep3Q99KK1 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Reep3Q99KK1 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Reep3Q99KK1 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Reep3Q99KK1 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Reep3Q99KK1 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Reep3Q99KK1 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Reep3Q99KK1 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Reep3Q99KK1 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Reep3Q99KK1 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Reep3Q99KK1 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Reep3Q99KK1 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Reep3Q99KK1 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Reep3Q99KK1 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Reep3Q99KK1 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Reep3Q99KK1 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Reep3Q99KK1 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Reep3Q99KK1 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Reep3Q99KK1 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Reep3Q99KK1 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Reep3Q99KK1 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Reep3Q99KK1 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Reep3Q99KK1 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Reep3Q99KK1 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Reep3Q99KK1 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Reep3Q99KK1 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Reep3Q99KK1 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Reep3Q99KK1 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Reep3Q99KK1 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Reep3Q99KK1 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Reep3Q99KK1 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Reep3Q99KK1 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Reep3Q99KK1 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Reep3Q99KK1 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Reep3Q99KK1 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Reep3Q99KK1 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Reep3Q99KK1 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Reep3Q99KK1 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Reep3Q99KK1 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Reep3Q99KK1 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Reep3Q99KK1 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Reep3Q99KK1 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Reep3Q99KK1 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Reep3Q99KK1 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Reep3Q99KK1 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Reep3Q99KK1 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Reep3Q99KK1 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Reep3Q99KK1 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Reep3Q99KK1 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Reep3Q99KK1 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Reep3Q99KK1 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Reep3Q99KK1 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Reep3Q99KK1 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Reep3Q99KK1 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Reep3Q99KK1 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Reep3Q99KK1 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Reep3Q99KK1 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Reep3Q99KK1 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Reep3Q99KK1 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Reep3Q99KK1 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Reep3Q99KK1 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Reep3Q99KK1 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Reep3Q99KK1 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Reep3Q99KK1 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Reep3Q99KK1 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Reep3Q99KK1 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Reep3Q99KK1 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Reep3Q99KK1 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Reep3Q99KK1 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Reep3Q99KK1 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Reep3Q99KK1 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Reep3Q99KK1 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Reep3Q99KK1 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Reep3Q99KK1 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Reep3Q99KK1 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Reep3Q99KK1 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Reep3Q99KK1 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Reep3Q99KK1 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms