Protein–RNA interactions for Protein: Q99JZ0

Sdcbp2, Syntenin-2, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdcbp2Q99JZ0 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sdcbp2Q99JZ0 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Sdcbp2Q99JZ0 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sdcbp2Q99JZ0 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Sdcbp2Q99JZ0 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Sdcbp2Q99JZ0 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sdcbp2Q99JZ0 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sdcbp2Q99JZ0 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sdcbp2Q99JZ0 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sdcbp2Q99JZ0 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sdcbp2Q99JZ0 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sdcbp2Q99JZ0 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sdcbp2Q99JZ0 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sdcbp2Q99JZ0 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sdcbp2Q99JZ0 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sdcbp2Q99JZ0 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sdcbp2Q99JZ0 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sdcbp2Q99JZ0 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sdcbp2Q99JZ0 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sdcbp2Q99JZ0 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sdcbp2Q99JZ0 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sdcbp2Q99JZ0 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sdcbp2Q99JZ0 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sdcbp2Q99JZ0 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sdcbp2Q99JZ0 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sdcbp2Q99JZ0 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sdcbp2Q99JZ0 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sdcbp2Q99JZ0 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sdcbp2Q99JZ0 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sdcbp2Q99JZ0 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sdcbp2Q99JZ0 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sdcbp2Q99JZ0 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sdcbp2Q99JZ0 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sdcbp2Q99JZ0 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Sdcbp2Q99JZ0 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Sdcbp2Q99JZ0 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Sdcbp2Q99JZ0 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Sdcbp2Q99JZ0 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sdcbp2Q99JZ0 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sdcbp2Q99JZ0 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sdcbp2Q99JZ0 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sdcbp2Q99JZ0 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Sdcbp2Q99JZ0 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sdcbp2Q99JZ0 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sdcbp2Q99JZ0 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sdcbp2Q99JZ0 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sdcbp2Q99JZ0 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sdcbp2Q99JZ0 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sdcbp2Q99JZ0 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sdcbp2Q99JZ0 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sdcbp2Q99JZ0 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sdcbp2Q99JZ0 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sdcbp2Q99JZ0 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sdcbp2Q99JZ0 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sdcbp2Q99JZ0 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sdcbp2Q99JZ0 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sdcbp2Q99JZ0 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sdcbp2Q99JZ0 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sdcbp2Q99JZ0 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sdcbp2Q99JZ0 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sdcbp2Q99JZ0 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sdcbp2Q99JZ0 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sdcbp2Q99JZ0 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sdcbp2Q99JZ0 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sdcbp2Q99JZ0 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sdcbp2Q99JZ0 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sdcbp2Q99JZ0 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sdcbp2Q99JZ0 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sdcbp2Q99JZ0 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sdcbp2Q99JZ0 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sdcbp2Q99JZ0 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sdcbp2Q99JZ0 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sdcbp2Q99JZ0 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sdcbp2Q99JZ0 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sdcbp2Q99JZ0 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sdcbp2Q99JZ0 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sdcbp2Q99JZ0 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sdcbp2Q99JZ0 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sdcbp2Q99JZ0 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sdcbp2Q99JZ0 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sdcbp2Q99JZ0 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sdcbp2Q99JZ0 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sdcbp2Q99JZ0 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sdcbp2Q99JZ0 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sdcbp2Q99JZ0 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sdcbp2Q99JZ0 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sdcbp2Q99JZ0 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Sdcbp2Q99JZ0 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Sdcbp2Q99JZ0 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sdcbp2Q99JZ0 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sdcbp2Q99JZ0 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sdcbp2Q99JZ0 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Sdcbp2Q99JZ0 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sdcbp2Q99JZ0 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sdcbp2Q99JZ0 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sdcbp2Q99JZ0 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sdcbp2Q99JZ0 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sdcbp2Q99JZ0 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sdcbp2Q99JZ0 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sdcbp2Q99JZ0 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms