Protein–RNA interactions for Protein: Q99JY6

Higd1b, HIG1 domain family member 1B, mousemouse

Predictions only

Length 98 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Higd1bQ99JY6 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Higd1bQ99JY6 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Higd1bQ99JY6 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Higd1bQ99JY6 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Higd1bQ99JY6 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Higd1bQ99JY6 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Higd1bQ99JY6 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Higd1bQ99JY6 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Higd1bQ99JY6 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Higd1bQ99JY6 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Higd1bQ99JY6 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Higd1bQ99JY6 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Higd1bQ99JY6 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Higd1bQ99JY6 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Higd1bQ99JY6 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Higd1bQ99JY6 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Higd1bQ99JY6 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Higd1bQ99JY6 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Higd1bQ99JY6 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Higd1bQ99JY6 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Higd1bQ99JY6 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Higd1bQ99JY6 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Higd1bQ99JY6 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Higd1bQ99JY6 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Higd1bQ99JY6 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Higd1bQ99JY6 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Higd1bQ99JY6 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Higd1bQ99JY6 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Higd1bQ99JY6 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Higd1bQ99JY6 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Higd1bQ99JY6 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Higd1bQ99JY6 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Higd1bQ99JY6 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Higd1bQ99JY6 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Higd1bQ99JY6 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Higd1bQ99JY6 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Higd1bQ99JY6 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Higd1bQ99JY6 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Higd1bQ99JY6 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Higd1bQ99JY6 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Higd1bQ99JY6 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Higd1bQ99JY6 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Higd1bQ99JY6 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Higd1bQ99JY6 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Higd1bQ99JY6 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Higd1bQ99JY6 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Higd1bQ99JY6 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Higd1bQ99JY6 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Higd1bQ99JY6 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Higd1bQ99JY6 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Higd1bQ99JY6 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Higd1bQ99JY6 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Higd1bQ99JY6 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Higd1bQ99JY6 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Higd1bQ99JY6 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Higd1bQ99JY6 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Higd1bQ99JY6 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Higd1bQ99JY6 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Higd1bQ99JY6 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Higd1bQ99JY6 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Higd1bQ99JY6 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Higd1bQ99JY6 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Higd1bQ99JY6 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Higd1bQ99JY6 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Higd1bQ99JY6 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Higd1bQ99JY6 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Higd1bQ99JY6 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Higd1bQ99JY6 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Higd1bQ99JY6 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Higd1bQ99JY6 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Higd1bQ99JY6 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Higd1bQ99JY6 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Higd1bQ99JY6 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Higd1bQ99JY6 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Higd1bQ99JY6 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Higd1bQ99JY6 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Higd1bQ99JY6 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Higd1bQ99JY6 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Higd1bQ99JY6 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Higd1bQ99JY6 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Higd1bQ99JY6 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Higd1bQ99JY6 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Higd1bQ99JY6 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Higd1bQ99JY6 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Higd1bQ99JY6 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Higd1bQ99JY6 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Higd1bQ99JY6 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Higd1bQ99JY6 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Higd1bQ99JY6 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Higd1bQ99JY6 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Higd1bQ99JY6 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Higd1bQ99JY6 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Higd1bQ99JY6 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Higd1bQ99JY6 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Higd1bQ99JY6 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Higd1bQ99JY6 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Higd1bQ99JY6 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Higd1bQ99JY6 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Higd1bQ99JY6 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Higd1bQ99JY6 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms