Protein–RNA interactions for Protein: Q99JX1

Taf11, Transcription initiation factor TFIID subunit 11, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf11Q99JX1 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Taf11Q99JX1 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Taf11Q99JX1 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Taf11Q99JX1 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Taf11Q99JX1 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Taf11Q99JX1 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Taf11Q99JX1 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Taf11Q99JX1 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Taf11Q99JX1 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Taf11Q99JX1 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Taf11Q99JX1 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Taf11Q99JX1 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Taf11Q99JX1 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Taf11Q99JX1 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Taf11Q99JX1 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Taf11Q99JX1 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Taf11Q99JX1 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Taf11Q99JX1 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Taf11Q99JX1 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Taf11Q99JX1 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Taf11Q99JX1 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Taf11Q99JX1 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Taf11Q99JX1 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Taf11Q99JX1 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Taf11Q99JX1 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Taf11Q99JX1 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Taf11Q99JX1 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Taf11Q99JX1 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Taf11Q99JX1 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Taf11Q99JX1 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Taf11Q99JX1 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Taf11Q99JX1 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Taf11Q99JX1 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Taf11Q99JX1 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Taf11Q99JX1 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Taf11Q99JX1 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Taf11Q99JX1 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Taf11Q99JX1 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Taf11Q99JX1 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Taf11Q99JX1 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Taf11Q99JX1 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Taf11Q99JX1 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Taf11Q99JX1 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Taf11Q99JX1 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Taf11Q99JX1 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Taf11Q99JX1 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Taf11Q99JX1 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Taf11Q99JX1 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Taf11Q99JX1 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Taf11Q99JX1 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Taf11Q99JX1 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Taf11Q99JX1 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Taf11Q99JX1 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Taf11Q99JX1 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Taf11Q99JX1 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Taf11Q99JX1 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Taf11Q99JX1 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Taf11Q99JX1 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Taf11Q99JX1 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Taf11Q99JX1 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Taf11Q99JX1 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Taf11Q99JX1 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Taf11Q99JX1 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Taf11Q99JX1 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Taf11Q99JX1 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Taf11Q99JX1 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Taf11Q99JX1 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Taf11Q99JX1 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Taf11Q99JX1 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Taf11Q99JX1 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Taf11Q99JX1 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Taf11Q99JX1 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Taf11Q99JX1 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Taf11Q99JX1 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Taf11Q99JX1 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Taf11Q99JX1 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Taf11Q99JX1 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Taf11Q99JX1 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Taf11Q99JX1 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Taf11Q99JX1 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Taf11Q99JX1 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Taf11Q99JX1 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Taf11Q99JX1 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Taf11Q99JX1 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Taf11Q99JX1 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Taf11Q99JX1 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Taf11Q99JX1 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Taf11Q99JX1 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Taf11Q99JX1 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Taf11Q99JX1 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Taf11Q99JX1 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Taf11Q99JX1 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Taf11Q99JX1 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Taf11Q99JX1 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Taf11Q99JX1 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Taf11Q99JX1 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Taf11Q99JX1 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Taf11Q99JX1 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Taf11Q99JX1 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Taf11Q99JX1 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms