Protein–RNA interactions for Protein: Q99JW4

Lims1, LIM and senescent cell antigen-like-containing domain protein 1, mousemouse

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Length 325 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lims1Q99JW4 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lims1Q99JW4 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lims1Q99JW4 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Lims1Q99JW4 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lims1Q99JW4 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lims1Q99JW4 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lims1Q99JW4 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lims1Q99JW4 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lims1Q99JW4 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lims1Q99JW4 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lims1Q99JW4 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lims1Q99JW4 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lims1Q99JW4 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lims1Q99JW4 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lims1Q99JW4 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lims1Q99JW4 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Lims1Q99JW4 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lims1Q99JW4 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lims1Q99JW4 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lims1Q99JW4 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lims1Q99JW4 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lims1Q99JW4 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Lims1Q99JW4 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lims1Q99JW4 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lims1Q99JW4 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lims1Q99JW4 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lims1Q99JW4 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lims1Q99JW4 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lims1Q99JW4 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lims1Q99JW4 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lims1Q99JW4 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lims1Q99JW4 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lims1Q99JW4 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lims1Q99JW4 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lims1Q99JW4 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lims1Q99JW4 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lims1Q99JW4 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Lims1Q99JW4 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lims1Q99JW4 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lims1Q99JW4 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lims1Q99JW4 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lims1Q99JW4 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lims1Q99JW4 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lims1Q99JW4 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lims1Q99JW4 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Lims1Q99JW4 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Lims1Q99JW4 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lims1Q99JW4 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lims1Q99JW4 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lims1Q99JW4 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lims1Q99JW4 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lims1Q99JW4 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lims1Q99JW4 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lims1Q99JW4 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lims1Q99JW4 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lims1Q99JW4 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lims1Q99JW4 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lims1Q99JW4 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lims1Q99JW4 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lims1Q99JW4 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lims1Q99JW4 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lims1Q99JW4 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lims1Q99JW4 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lims1Q99JW4 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Lims1Q99JW4 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lims1Q99JW4 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lims1Q99JW4 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lims1Q99JW4 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lims1Q99JW4 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lims1Q99JW4 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lims1Q99JW4 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lims1Q99JW4 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lims1Q99JW4 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lims1Q99JW4 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lims1Q99JW4 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lims1Q99JW4 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lims1Q99JW4 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lims1Q99JW4 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lims1Q99JW4 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lims1Q99JW4 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lims1Q99JW4 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lims1Q99JW4 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Lims1Q99JW4 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Lims1Q99JW4 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lims1Q99JW4 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lims1Q99JW4 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lims1Q99JW4 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lims1Q99JW4 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lims1Q99JW4 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Lims1Q99JW4 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lims1Q99JW4 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lims1Q99JW4 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lims1Q99JW4 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lims1Q99JW4 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lims1Q99JW4 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lims1Q99JW4 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lims1Q99JW4 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lims1Q99JW4 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lims1Q99JW4 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Lims1Q99JW4 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
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