Protein–RNA interactions for Protein: Q99JT5

Krcc1, Lysine-rich coiled-coil protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krcc1Q99JT5 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Krcc1Q99JT5 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Krcc1Q99JT5 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Krcc1Q99JT5 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Krcc1Q99JT5 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Krcc1Q99JT5 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Krcc1Q99JT5 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Krcc1Q99JT5 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Krcc1Q99JT5 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Krcc1Q99JT5 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Krcc1Q99JT5 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Krcc1Q99JT5 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Krcc1Q99JT5 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Krcc1Q99JT5 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Krcc1Q99JT5 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Krcc1Q99JT5 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Krcc1Q99JT5 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Krcc1Q99JT5 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Krcc1Q99JT5 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Krcc1Q99JT5 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Krcc1Q99JT5 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Krcc1Q99JT5 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Krcc1Q99JT5 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Krcc1Q99JT5 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Krcc1Q99JT5 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Krcc1Q99JT5 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Krcc1Q99JT5 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Krcc1Q99JT5 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Krcc1Q99JT5 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Krcc1Q99JT5 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Krcc1Q99JT5 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Krcc1Q99JT5 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Krcc1Q99JT5 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Krcc1Q99JT5 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Krcc1Q99JT5 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Krcc1Q99JT5 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Krcc1Q99JT5 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Krcc1Q99JT5 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Krcc1Q99JT5 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Krcc1Q99JT5 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Krcc1Q99JT5 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Krcc1Q99JT5 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Krcc1Q99JT5 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Krcc1Q99JT5 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Krcc1Q99JT5 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Krcc1Q99JT5 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Krcc1Q99JT5 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Krcc1Q99JT5 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Krcc1Q99JT5 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Krcc1Q99JT5 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Krcc1Q99JT5 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Krcc1Q99JT5 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Krcc1Q99JT5 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Krcc1Q99JT5 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Krcc1Q99JT5 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Krcc1Q99JT5 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Krcc1Q99JT5 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Krcc1Q99JT5 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Krcc1Q99JT5 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Krcc1Q99JT5 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Krcc1Q99JT5 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Krcc1Q99JT5 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Krcc1Q99JT5 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Krcc1Q99JT5 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Krcc1Q99JT5 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Krcc1Q99JT5 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Krcc1Q99JT5 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Krcc1Q99JT5 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Krcc1Q99JT5 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Krcc1Q99JT5 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Krcc1Q99JT5 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Krcc1Q99JT5 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Krcc1Q99JT5 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Krcc1Q99JT5 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Krcc1Q99JT5 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Krcc1Q99JT5 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Krcc1Q99JT5 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Krcc1Q99JT5 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Krcc1Q99JT5 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Krcc1Q99JT5 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Krcc1Q99JT5 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Krcc1Q99JT5 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Krcc1Q99JT5 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Krcc1Q99JT5 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Krcc1Q99JT5 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Krcc1Q99JT5 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Krcc1Q99JT5 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Krcc1Q99JT5 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Krcc1Q99JT5 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Krcc1Q99JT5 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Krcc1Q99JT5 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Krcc1Q99JT5 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Krcc1Q99JT5 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Krcc1Q99JT5 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Krcc1Q99JT5 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Krcc1Q99JT5 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Krcc1Q99JT5 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Krcc1Q99JT5 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Krcc1Q99JT5 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Krcc1Q99JT5 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms