Protein–RNA interactions for Protein: Q99JR1

Sfxn1, Sideroflexin-1, mousemouse

Predictions only

Length 322 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfxn1Q99JR1 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sfxn1Q99JR1 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sfxn1Q99JR1 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sfxn1Q99JR1 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sfxn1Q99JR1 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Sfxn1Q99JR1 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sfxn1Q99JR1 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sfxn1Q99JR1 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sfxn1Q99JR1 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Sfxn1Q99JR1 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sfxn1Q99JR1 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sfxn1Q99JR1 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sfxn1Q99JR1 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sfxn1Q99JR1 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sfxn1Q99JR1 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sfxn1Q99JR1 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sfxn1Q99JR1 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sfxn1Q99JR1 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sfxn1Q99JR1 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sfxn1Q99JR1 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sfxn1Q99JR1 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sfxn1Q99JR1 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sfxn1Q99JR1 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sfxn1Q99JR1 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sfxn1Q99JR1 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sfxn1Q99JR1 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sfxn1Q99JR1 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Sfxn1Q99JR1 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sfxn1Q99JR1 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Sfxn1Q99JR1 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sfxn1Q99JR1 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sfxn1Q99JR1 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sfxn1Q99JR1 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sfxn1Q99JR1 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Sfxn1Q99JR1 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sfxn1Q99JR1 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sfxn1Q99JR1 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sfxn1Q99JR1 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sfxn1Q99JR1 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sfxn1Q99JR1 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sfxn1Q99JR1 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sfxn1Q99JR1 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sfxn1Q99JR1 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sfxn1Q99JR1 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sfxn1Q99JR1 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sfxn1Q99JR1 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sfxn1Q99JR1 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sfxn1Q99JR1 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sfxn1Q99JR1 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sfxn1Q99JR1 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sfxn1Q99JR1 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sfxn1Q99JR1 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sfxn1Q99JR1 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sfxn1Q99JR1 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Sfxn1Q99JR1 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sfxn1Q99JR1 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sfxn1Q99JR1 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sfxn1Q99JR1 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sfxn1Q99JR1 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sfxn1Q99JR1 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sfxn1Q99JR1 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sfxn1Q99JR1 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sfxn1Q99JR1 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sfxn1Q99JR1 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sfxn1Q99JR1 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sfxn1Q99JR1 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sfxn1Q99JR1 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sfxn1Q99JR1 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sfxn1Q99JR1 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sfxn1Q99JR1 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sfxn1Q99JR1 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sfxn1Q99JR1 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sfxn1Q99JR1 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sfxn1Q99JR1 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sfxn1Q99JR1 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sfxn1Q99JR1 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sfxn1Q99JR1 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sfxn1Q99JR1 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sfxn1Q99JR1 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sfxn1Q99JR1 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sfxn1Q99JR1 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sfxn1Q99JR1 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sfxn1Q99JR1 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sfxn1Q99JR1 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sfxn1Q99JR1 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sfxn1Q99JR1 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sfxn1Q99JR1 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Sfxn1Q99JR1 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Sfxn1Q99JR1 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Sfxn1Q99JR1 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Sfxn1Q99JR1 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Sfxn1Q99JR1 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Sfxn1Q99JR1 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Sfxn1Q99JR1 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Sfxn1Q99JR1 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Sfxn1Q99JR1 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sfxn1Q99JR1 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sfxn1Q99JR1 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sfxn1Q99JR1 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sfxn1Q99JR1 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms