Protein–RNA interactions for Protein: Q99JF8

Psip1, PC4 and SFRS1-interacting protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psip1Q99JF8 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Psip1Q99JF8 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Psip1Q99JF8 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Psip1Q99JF8 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Psip1Q99JF8 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Psip1Q99JF8 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Psip1Q99JF8 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Psip1Q99JF8 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Psip1Q99JF8 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Psip1Q99JF8 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Psip1Q99JF8 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Psip1Q99JF8 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Psip1Q99JF8 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Psip1Q99JF8 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Psip1Q99JF8 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Psip1Q99JF8 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Psip1Q99JF8 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Psip1Q99JF8 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Psip1Q99JF8 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Psip1Q99JF8 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Psip1Q99JF8 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Psip1Q99JF8 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Psip1Q99JF8 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Psip1Q99JF8 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Psip1Q99JF8 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Psip1Q99JF8 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Psip1Q99JF8 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Psip1Q99JF8 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Psip1Q99JF8 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Psip1Q99JF8 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Psip1Q99JF8 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Psip1Q99JF8 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Psip1Q99JF8 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Psip1Q99JF8 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Psip1Q99JF8 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Psip1Q99JF8 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Psip1Q99JF8 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Psip1Q99JF8 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Psip1Q99JF8 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Psip1Q99JF8 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Psip1Q99JF8 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Psip1Q99JF8 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Psip1Q99JF8 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Psip1Q99JF8 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Psip1Q99JF8 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Psip1Q99JF8 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Psip1Q99JF8 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Psip1Q99JF8 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Psip1Q99JF8 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Psip1Q99JF8 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Psip1Q99JF8 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Psip1Q99JF8 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Psip1Q99JF8 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Psip1Q99JF8 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Psip1Q99JF8 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Psip1Q99JF8 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Psip1Q99JF8 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Psip1Q99JF8 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Psip1Q99JF8 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Psip1Q99JF8 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Psip1Q99JF8 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Psip1Q99JF8 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Psip1Q99JF8 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Psip1Q99JF8 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Psip1Q99JF8 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Psip1Q99JF8 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Psip1Q99JF8 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Psip1Q99JF8 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Psip1Q99JF8 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Psip1Q99JF8 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Psip1Q99JF8 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Psip1Q99JF8 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Psip1Q99JF8 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Psip1Q99JF8 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Psip1Q99JF8 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Psip1Q99JF8 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Psip1Q99JF8 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Psip1Q99JF8 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Psip1Q99JF8 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Psip1Q99JF8 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Psip1Q99JF8 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Psip1Q99JF8 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Psip1Q99JF8 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Psip1Q99JF8 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Psip1Q99JF8 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Psip1Q99JF8 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Psip1Q99JF8 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Psip1Q99JF8 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Psip1Q99JF8 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Psip1Q99JF8 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Psip1Q99JF8 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Psip1Q99JF8 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Psip1Q99JF8 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Psip1Q99JF8 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Psip1Q99JF8 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Psip1Q99JF8 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Psip1Q99JF8 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Psip1Q99JF8 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Psip1Q99JF8 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Psip1Q99JF8 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms