Protein–RNA interactions for Protein: Q99J59

Tspan1, Tetraspanin-1, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan1Q99J59 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tspan1Q99J59 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tspan1Q99J59 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tspan1Q99J59 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tspan1Q99J59 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tspan1Q99J59 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tspan1Q99J59 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tspan1Q99J59 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tspan1Q99J59 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tspan1Q99J59 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tspan1Q99J59 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tspan1Q99J59 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tspan1Q99J59 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tspan1Q99J59 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tspan1Q99J59 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tspan1Q99J59 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Tspan1Q99J59 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tspan1Q99J59 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tspan1Q99J59 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tspan1Q99J59 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tspan1Q99J59 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tspan1Q99J59 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tspan1Q99J59 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tspan1Q99J59 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tspan1Q99J59 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tspan1Q99J59 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tspan1Q99J59 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tspan1Q99J59 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tspan1Q99J59 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tspan1Q99J59 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tspan1Q99J59 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tspan1Q99J59 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tspan1Q99J59 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tspan1Q99J59 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tspan1Q99J59 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tspan1Q99J59 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tspan1Q99J59 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tspan1Q99J59 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tspan1Q99J59 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tspan1Q99J59 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tspan1Q99J59 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tspan1Q99J59 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tspan1Q99J59 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tspan1Q99J59 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tspan1Q99J59 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tspan1Q99J59 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tspan1Q99J59 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tspan1Q99J59 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tspan1Q99J59 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tspan1Q99J59 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tspan1Q99J59 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tspan1Q99J59 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tspan1Q99J59 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tspan1Q99J59 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tspan1Q99J59 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tspan1Q99J59 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tspan1Q99J59 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tspan1Q99J59 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tspan1Q99J59 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tspan1Q99J59 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tspan1Q99J59 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tspan1Q99J59 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tspan1Q99J59 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tspan1Q99J59 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tspan1Q99J59 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Tspan1Q99J59 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tspan1Q99J59 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tspan1Q99J59 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tspan1Q99J59 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tspan1Q99J59 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tspan1Q99J59 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tspan1Q99J59 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Tspan1Q99J59 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tspan1Q99J59 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tspan1Q99J59 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tspan1Q99J59 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tspan1Q99J59 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tspan1Q99J59 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Tspan1Q99J59 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tspan1Q99J59 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tspan1Q99J59 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Tspan1Q99J59 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tspan1Q99J59 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Tspan1Q99J59 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tspan1Q99J59 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tspan1Q99J59 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tspan1Q99J59 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tspan1Q99J59 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tspan1Q99J59 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tspan1Q99J59 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tspan1Q99J59 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Tspan1Q99J59 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tspan1Q99J59 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tspan1Q99J59 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tspan1Q99J59 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tspan1Q99J59 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tspan1Q99J59 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tspan1Q99J59 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tspan1Q99J59 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tspan1Q99J59 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.4 ms