Protein–RNA interactions for Protein: Q99J19

Smim11a, Small integral membrane protein 11A, mousemouse

Predictions only

Length 55 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim11aQ99J19 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smim11aQ99J19 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Smim11aQ99J19 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smim11aQ99J19 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smim11aQ99J19 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smim11aQ99J19 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smim11aQ99J19 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smim11aQ99J19 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smim11aQ99J19 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smim11aQ99J19 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smim11aQ99J19 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smim11aQ99J19 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smim11aQ99J19 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smim11aQ99J19 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smim11aQ99J19 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smim11aQ99J19 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smim11aQ99J19 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smim11aQ99J19 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smim11aQ99J19 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smim11aQ99J19 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Smim11aQ99J19 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smim11aQ99J19 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smim11aQ99J19 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smim11aQ99J19 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smim11aQ99J19 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smim11aQ99J19 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smim11aQ99J19 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smim11aQ99J19 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smim11aQ99J19 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smim11aQ99J19 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smim11aQ99J19 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smim11aQ99J19 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Smim11aQ99J19 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smim11aQ99J19 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smim11aQ99J19 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smim11aQ99J19 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smim11aQ99J19 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smim11aQ99J19 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smim11aQ99J19 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smim11aQ99J19 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smim11aQ99J19 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smim11aQ99J19 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smim11aQ99J19 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smim11aQ99J19 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smim11aQ99J19 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smim11aQ99J19 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Smim11aQ99J19 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Smim11aQ99J19 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Smim11aQ99J19 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Smim11aQ99J19 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Smim11aQ99J19 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smim11aQ99J19 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smim11aQ99J19 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smim11aQ99J19 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smim11aQ99J19 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smim11aQ99J19 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smim11aQ99J19 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smim11aQ99J19 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smim11aQ99J19 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smim11aQ99J19 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smim11aQ99J19 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smim11aQ99J19 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smim11aQ99J19 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smim11aQ99J19 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smim11aQ99J19 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smim11aQ99J19 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smim11aQ99J19 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smim11aQ99J19 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smim11aQ99J19 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smim11aQ99J19 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smim11aQ99J19 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smim11aQ99J19 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smim11aQ99J19 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smim11aQ99J19 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smim11aQ99J19 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smim11aQ99J19 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smim11aQ99J19 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smim11aQ99J19 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smim11aQ99J19 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smim11aQ99J19 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smim11aQ99J19 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smim11aQ99J19 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smim11aQ99J19 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smim11aQ99J19 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Smim11aQ99J19 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smim11aQ99J19 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smim11aQ99J19 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smim11aQ99J19 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smim11aQ99J19 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smim11aQ99J19 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smim11aQ99J19 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smim11aQ99J19 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smim11aQ99J19 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smim11aQ99J19 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smim11aQ99J19 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Smim11aQ99J19 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Smim11aQ99J19 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smim11aQ99J19 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smim11aQ99J19 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smim11aQ99J19 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms