Protein–RNA interactions for Protein: Q99J10

Ctu1, Cytoplasmic tRNA 2-thiolation protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctu1Q99J10 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ctu1Q99J10 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ctu1Q99J10 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ctu1Q99J10 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ctu1Q99J10 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ctu1Q99J10 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ctu1Q99J10 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ctu1Q99J10 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ctu1Q99J10 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ctu1Q99J10 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ctu1Q99J10 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ctu1Q99J10 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ctu1Q99J10 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ctu1Q99J10 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ctu1Q99J10 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ctu1Q99J10 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ctu1Q99J10 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ctu1Q99J10 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ctu1Q99J10 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ctu1Q99J10 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ctu1Q99J10 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ctu1Q99J10 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ctu1Q99J10 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ctu1Q99J10 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ctu1Q99J10 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ctu1Q99J10 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ctu1Q99J10 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ctu1Q99J10 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Ctu1Q99J10 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Ctu1Q99J10 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ctu1Q99J10 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ctu1Q99J10 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ctu1Q99J10 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ctu1Q99J10 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ctu1Q99J10 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ctu1Q99J10 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ctu1Q99J10 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ctu1Q99J10 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ctu1Q99J10 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ctu1Q99J10 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ctu1Q99J10 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ctu1Q99J10 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ctu1Q99J10 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ctu1Q99J10 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ctu1Q99J10 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ctu1Q99J10 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ctu1Q99J10 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ctu1Q99J10 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ctu1Q99J10 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ctu1Q99J10 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ctu1Q99J10 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ctu1Q99J10 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ctu1Q99J10 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ctu1Q99J10 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ctu1Q99J10 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ctu1Q99J10 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ctu1Q99J10 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ctu1Q99J10 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ctu1Q99J10 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ctu1Q99J10 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ctu1Q99J10 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ctu1Q99J10 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ctu1Q99J10 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ctu1Q99J10 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ctu1Q99J10 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ctu1Q99J10 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ctu1Q99J10 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Ctu1Q99J10 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ctu1Q99J10 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Ctu1Q99J10 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ctu1Q99J10 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ctu1Q99J10 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ctu1Q99J10 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ctu1Q99J10 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ctu1Q99J10 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ctu1Q99J10 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ctu1Q99J10 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ctu1Q99J10 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ctu1Q99J10 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ctu1Q99J10 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ctu1Q99J10 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ctu1Q99J10 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ctu1Q99J10 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ctu1Q99J10 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ctu1Q99J10 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ctu1Q99J10 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ctu1Q99J10 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ctu1Q99J10 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ctu1Q99J10 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Ctu1Q99J10 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ctu1Q99J10 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ctu1Q99J10 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ctu1Q99J10 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ctu1Q99J10 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ctu1Q99J10 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ctu1Q99J10 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ctu1Q99J10 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ctu1Q99J10 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ctu1Q99J10 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ctu1Q99J10 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms