Protein–RNA interactions for Protein: Q925Q3

Slc8b1, Mitochondrial sodium/calcium exchanger protein, mousemouse

Predictions only

Length 585 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc8b1Q925Q3 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slc8b1Q925Q3 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slc8b1Q925Q3 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slc8b1Q925Q3 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slc8b1Q925Q3 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slc8b1Q925Q3 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slc8b1Q925Q3 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slc8b1Q925Q3 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slc8b1Q925Q3 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slc8b1Q925Q3 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slc8b1Q925Q3 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slc8b1Q925Q3 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc8b1Q925Q3 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc8b1Q925Q3 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc8b1Q925Q3 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc8b1Q925Q3 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc8b1Q925Q3 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc8b1Q925Q3 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc8b1Q925Q3 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc8b1Q925Q3 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc8b1Q925Q3 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc8b1Q925Q3 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc8b1Q925Q3 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc8b1Q925Q3 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc8b1Q925Q3 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc8b1Q925Q3 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc8b1Q925Q3 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc8b1Q925Q3 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc8b1Q925Q3 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc8b1Q925Q3 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc8b1Q925Q3 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc8b1Q925Q3 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc8b1Q925Q3 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc8b1Q925Q3 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc8b1Q925Q3 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc8b1Q925Q3 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc8b1Q925Q3 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc8b1Q925Q3 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc8b1Q925Q3 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc8b1Q925Q3 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc8b1Q925Q3 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc8b1Q925Q3 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc8b1Q925Q3 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc8b1Q925Q3 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc8b1Q925Q3 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc8b1Q925Q3 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc8b1Q925Q3 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc8b1Q925Q3 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc8b1Q925Q3 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc8b1Q925Q3 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc8b1Q925Q3 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc8b1Q925Q3 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc8b1Q925Q3 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc8b1Q925Q3 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc8b1Q925Q3 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc8b1Q925Q3 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc8b1Q925Q3 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slc8b1Q925Q3 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slc8b1Q925Q3 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slc8b1Q925Q3 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slc8b1Q925Q3 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slc8b1Q925Q3 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slc8b1Q925Q3 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slc8b1Q925Q3 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slc8b1Q925Q3 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slc8b1Q925Q3 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Slc8b1Q925Q3 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slc8b1Q925Q3 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slc8b1Q925Q3 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slc8b1Q925Q3 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Slc8b1Q925Q3 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Slc8b1Q925Q3 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slc8b1Q925Q3 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slc8b1Q925Q3 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slc8b1Q925Q3 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slc8b1Q925Q3 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slc8b1Q925Q3 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slc8b1Q925Q3 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slc8b1Q925Q3 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slc8b1Q925Q3 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slc8b1Q925Q3 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slc8b1Q925Q3 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slc8b1Q925Q3 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slc8b1Q925Q3 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slc8b1Q925Q3 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slc8b1Q925Q3 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slc8b1Q925Q3 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slc8b1Q925Q3 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slc8b1Q925Q3 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slc8b1Q925Q3 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slc8b1Q925Q3 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slc8b1Q925Q3 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slc8b1Q925Q3 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slc8b1Q925Q3 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slc8b1Q925Q3 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slc8b1Q925Q3 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slc8b1Q925Q3 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slc8b1Q925Q3 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slc8b1Q925Q3 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slc8b1Q925Q3 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms