Protein–RNA interactions for Protein: Q923T7

Trim7, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM7, mousemouse

Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim7Q923T7 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim7Q923T7 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim7Q923T7 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim7Q923T7 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim7Q923T7 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim7Q923T7 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim7Q923T7 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim7Q923T7 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim7Q923T7 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim7Q923T7 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim7Q923T7 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim7Q923T7 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim7Q923T7 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim7Q923T7 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim7Q923T7 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim7Q923T7 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim7Q923T7 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim7Q923T7 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim7Q923T7 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim7Q923T7 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim7Q923T7 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim7Q923T7 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim7Q923T7 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim7Q923T7 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim7Q923T7 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim7Q923T7 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim7Q923T7 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim7Q923T7 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim7Q923T7 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim7Q923T7 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim7Q923T7 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim7Q923T7 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim7Q923T7 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim7Q923T7 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim7Q923T7 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim7Q923T7 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim7Q923T7 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim7Q923T7 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim7Q923T7 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim7Q923T7 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim7Q923T7 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim7Q923T7 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim7Q923T7 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim7Q923T7 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim7Q923T7 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim7Q923T7 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim7Q923T7 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim7Q923T7 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim7Q923T7 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim7Q923T7 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim7Q923T7 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim7Q923T7 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim7Q923T7 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim7Q923T7 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim7Q923T7 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim7Q923T7 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim7Q923T7 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim7Q923T7 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim7Q923T7 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim7Q923T7 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim7Q923T7 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim7Q923T7 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim7Q923T7 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim7Q923T7 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim7Q923T7 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim7Q923T7 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim7Q923T7 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim7Q923T7 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim7Q923T7 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim7Q923T7 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim7Q923T7 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim7Q923T7 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim7Q923T7 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim7Q923T7 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim7Q923T7 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim7Q923T7 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim7Q923T7 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim7Q923T7 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim7Q923T7 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim7Q923T7 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim7Q923T7 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim7Q923T7 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim7Q923T7 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim7Q923T7 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim7Q923T7 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim7Q923T7 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim7Q923T7 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim7Q923T7 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim7Q923T7 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Trim7Q923T7 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Trim7Q923T7 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Trim7Q923T7 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Trim7Q923T7 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Trim7Q923T7 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trim7Q923T7 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trim7Q923T7 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trim7Q923T7 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trim7Q923T7 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Trim7Q923T7 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Trim7Q923T7 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms