Protein–RNA interactions for Protein: Q923L3

Csmd1, CUB and sushi domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 3,564 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csmd1Q923L3 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Csmd1Q923L3 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Csmd1Q923L3 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Csmd1Q923L3 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Csmd1Q923L3 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Csmd1Q923L3 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Csmd1Q923L3 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Csmd1Q923L3 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Csmd1Q923L3 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Csmd1Q923L3 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Csmd1Q923L3 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Csmd1Q923L3 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Csmd1Q923L3 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Csmd1Q923L3 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Csmd1Q923L3 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Csmd1Q923L3 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Csmd1Q923L3 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Csmd1Q923L3 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Csmd1Q923L3 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Csmd1Q923L3 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Csmd1Q923L3 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Csmd1Q923L3 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Csmd1Q923L3 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Csmd1Q923L3 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Csmd1Q923L3 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Csmd1Q923L3 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Csmd1Q923L3 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Csmd1Q923L3 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Csmd1Q923L3 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Csmd1Q923L3 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Csmd1Q923L3 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Csmd1Q923L3 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Csmd1Q923L3 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Csmd1Q923L3 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Csmd1Q923L3 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Csmd1Q923L3 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Csmd1Q923L3 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Csmd1Q923L3 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Csmd1Q923L3 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Csmd1Q923L3 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Csmd1Q923L3 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Csmd1Q923L3 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Csmd1Q923L3 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Csmd1Q923L3 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Csmd1Q923L3 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Csmd1Q923L3 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Csmd1Q923L3 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Csmd1Q923L3 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Csmd1Q923L3 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Csmd1Q923L3 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Csmd1Q923L3 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Csmd1Q923L3 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Csmd1Q923L3 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Csmd1Q923L3 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Csmd1Q923L3 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Csmd1Q923L3 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Csmd1Q923L3 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Csmd1Q923L3 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Csmd1Q923L3 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Csmd1Q923L3 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Csmd1Q923L3 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Csmd1Q923L3 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Csmd1Q923L3 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Csmd1Q923L3 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Csmd1Q923L3 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Csmd1Q923L3 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Csmd1Q923L3 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Csmd1Q923L3 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Csmd1Q923L3 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Csmd1Q923L3 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Csmd1Q923L3 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Csmd1Q923L3 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Csmd1Q923L3 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Csmd1Q923L3 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Csmd1Q923L3 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Csmd1Q923L3 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Csmd1Q923L3 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Csmd1Q923L3 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Csmd1Q923L3 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Csmd1Q923L3 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Csmd1Q923L3 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Csmd1Q923L3 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Csmd1Q923L3 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Csmd1Q923L3 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Csmd1Q923L3 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Csmd1Q923L3 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Csmd1Q923L3 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Csmd1Q923L3 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Csmd1Q923L3 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Csmd1Q923L3 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Csmd1Q923L3 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Csmd1Q923L3 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Csmd1Q923L3 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Csmd1Q923L3 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Csmd1Q923L3 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Csmd1Q923L3 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Csmd1Q923L3 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Csmd1Q923L3 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Csmd1Q923L3 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Csmd1Q923L3 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
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