Protein–RNA interactions for Protein: Q923B3

Nrif1, Neurotrophin receptor-interacting factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 828 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrif1Q923B3 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nrif1Q923B3 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nrif1Q923B3 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nrif1Q923B3 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nrif1Q923B3 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nrif1Q923B3 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nrif1Q923B3 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nrif1Q923B3 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nrif1Q923B3 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nrif1Q923B3 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nrif1Q923B3 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nrif1Q923B3 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nrif1Q923B3 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nrif1Q923B3 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nrif1Q923B3 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nrif1Q923B3 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nrif1Q923B3 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nrif1Q923B3 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nrif1Q923B3 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nrif1Q923B3 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nrif1Q923B3 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nrif1Q923B3 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nrif1Q923B3 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nrif1Q923B3 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Nrif1Q923B3 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Nrif1Q923B3 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nrif1Q923B3 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nrif1Q923B3 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nrif1Q923B3 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nrif1Q923B3 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nrif1Q923B3 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nrif1Q923B3 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Nrif1Q923B3 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nrif1Q923B3 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nrif1Q923B3 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nrif1Q923B3 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Nrif1Q923B3 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nrif1Q923B3 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nrif1Q923B3 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nrif1Q923B3 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nrif1Q923B3 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nrif1Q923B3 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nrif1Q923B3 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nrif1Q923B3 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nrif1Q923B3 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nrif1Q923B3 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nrif1Q923B3 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nrif1Q923B3 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nrif1Q923B3 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nrif1Q923B3 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nrif1Q923B3 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nrif1Q923B3 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nrif1Q923B3 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Nrif1Q923B3 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nrif1Q923B3 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nrif1Q923B3 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nrif1Q923B3 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nrif1Q923B3 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nrif1Q923B3 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nrif1Q923B3 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nrif1Q923B3 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nrif1Q923B3 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nrif1Q923B3 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nrif1Q923B3 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nrif1Q923B3 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nrif1Q923B3 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nrif1Q923B3 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nrif1Q923B3 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nrif1Q923B3 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nrif1Q923B3 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nrif1Q923B3 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nrif1Q923B3 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nrif1Q923B3 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nrif1Q923B3 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nrif1Q923B3 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Nrif1Q923B3 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nrif1Q923B3 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nrif1Q923B3 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Nrif1Q923B3 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nrif1Q923B3 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nrif1Q923B3 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nrif1Q923B3 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nrif1Q923B3 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nrif1Q923B3 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nrif1Q923B3 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nrif1Q923B3 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nrif1Q923B3 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nrif1Q923B3 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nrif1Q923B3 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nrif1Q923B3 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nrif1Q923B3 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nrif1Q923B3 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nrif1Q923B3 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nrif1Q923B3 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nrif1Q923B3 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nrif1Q923B3 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nrif1Q923B3 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Nrif1Q923B3 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nrif1Q923B3 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nrif1Q923B3 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.4 ms