Protein–RNA interactions for Protein: Q920D3

Med28, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 28, mousemouse

Predictions only

Length 178 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med28Q920D3 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Med28Q920D3 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Med28Q920D3 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Med28Q920D3 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Med28Q920D3 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Med28Q920D3 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Med28Q920D3 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Med28Q920D3 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Med28Q920D3 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Med28Q920D3 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Med28Q920D3 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Med28Q920D3 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Med28Q920D3 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Med28Q920D3 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Med28Q920D3 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Med28Q920D3 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Med28Q920D3 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Med28Q920D3 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Med28Q920D3 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Med28Q920D3 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Med28Q920D3 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Med28Q920D3 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Med28Q920D3 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Med28Q920D3 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Med28Q920D3 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Med28Q920D3 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Med28Q920D3 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Med28Q920D3 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Med28Q920D3 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Med28Q920D3 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Med28Q920D3 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Med28Q920D3 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Med28Q920D3 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Med28Q920D3 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Med28Q920D3 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Med28Q920D3 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Med28Q920D3 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Med28Q920D3 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Med28Q920D3 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Med28Q920D3 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Med28Q920D3 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Med28Q920D3 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Med28Q920D3 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Med28Q920D3 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Med28Q920D3 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Med28Q920D3 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Med28Q920D3 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Med28Q920D3 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Med28Q920D3 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Med28Q920D3 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Med28Q920D3 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Med28Q920D3 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Med28Q920D3 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Med28Q920D3 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Med28Q920D3 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Med28Q920D3 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Med28Q920D3 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Med28Q920D3 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Med28Q920D3 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Med28Q920D3 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Med28Q920D3 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
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Med28Q920D3 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Med28Q920D3 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Med28Q920D3 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Med28Q920D3 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Med28Q920D3 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Med28Q920D3 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Med28Q920D3 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Med28Q920D3 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Med28Q920D3 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Med28Q920D3 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Med28Q920D3 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Med28Q920D3 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Med28Q920D3 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Med28Q920D3 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Med28Q920D3 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Med28Q920D3 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Med28Q920D3 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Med28Q920D3 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Med28Q920D3 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Med28Q920D3 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Med28Q920D3 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Med28Q920D3 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Med28Q920D3 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Med28Q920D3 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Med28Q920D3 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Med28Q920D3 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Med28Q920D3 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Med28Q920D3 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Med28Q920D3 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Med28Q920D3 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Med28Q920D3 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Med28Q920D3 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Med28Q920D3 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Med28Q920D3 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Med28Q920D3 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Med28Q920D3 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Med28Q920D3 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Med28Q920D3 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
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