Protein–RNA interactions for Protein: Q91YY4

Atpaf2, ATP synthase mitochondrial F1 complex assembly factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atpaf2Q91YY4 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atpaf2Q91YY4 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atpaf2Q91YY4 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atpaf2Q91YY4 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atpaf2Q91YY4 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atpaf2Q91YY4 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Atpaf2Q91YY4 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atpaf2Q91YY4 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atpaf2Q91YY4 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atpaf2Q91YY4 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atpaf2Q91YY4 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atpaf2Q91YY4 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atpaf2Q91YY4 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atpaf2Q91YY4 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atpaf2Q91YY4 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atpaf2Q91YY4 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atpaf2Q91YY4 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atpaf2Q91YY4 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atpaf2Q91YY4 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atpaf2Q91YY4 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atpaf2Q91YY4 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atpaf2Q91YY4 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Atpaf2Q91YY4 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atpaf2Q91YY4 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atpaf2Q91YY4 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atpaf2Q91YY4 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atpaf2Q91YY4 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Atpaf2Q91YY4 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atpaf2Q91YY4 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atpaf2Q91YY4 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atpaf2Q91YY4 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atpaf2Q91YY4 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atpaf2Q91YY4 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atpaf2Q91YY4 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atpaf2Q91YY4 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atpaf2Q91YY4 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atpaf2Q91YY4 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atpaf2Q91YY4 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atpaf2Q91YY4 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atpaf2Q91YY4 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atpaf2Q91YY4 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atpaf2Q91YY4 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atpaf2Q91YY4 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atpaf2Q91YY4 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atpaf2Q91YY4 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atpaf2Q91YY4 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atpaf2Q91YY4 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atpaf2Q91YY4 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Atpaf2Q91YY4 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atpaf2Q91YY4 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atpaf2Q91YY4 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atpaf2Q91YY4 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Atpaf2Q91YY4 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Atpaf2Q91YY4 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atpaf2Q91YY4 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atpaf2Q91YY4 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atpaf2Q91YY4 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atpaf2Q91YY4 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atpaf2Q91YY4 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Atpaf2Q91YY4 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Atpaf2Q91YY4 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Atpaf2Q91YY4 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Atpaf2Q91YY4 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Atpaf2Q91YY4 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Atpaf2Q91YY4 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atpaf2Q91YY4 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atpaf2Q91YY4 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atpaf2Q91YY4 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atpaf2Q91YY4 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atpaf2Q91YY4 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atpaf2Q91YY4 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atpaf2Q91YY4 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atpaf2Q91YY4 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atpaf2Q91YY4 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atpaf2Q91YY4 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atpaf2Q91YY4 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atpaf2Q91YY4 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atpaf2Q91YY4 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atpaf2Q91YY4 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atpaf2Q91YY4 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atpaf2Q91YY4 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atpaf2Q91YY4 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atpaf2Q91YY4 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atpaf2Q91YY4 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atpaf2Q91YY4 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atpaf2Q91YY4 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atpaf2Q91YY4 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atpaf2Q91YY4 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atpaf2Q91YY4 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atpaf2Q91YY4 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Atpaf2Q91YY4 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atpaf2Q91YY4 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atpaf2Q91YY4 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atpaf2Q91YY4 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atpaf2Q91YY4 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atpaf2Q91YY4 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atpaf2Q91YY4 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atpaf2Q91YY4 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Atpaf2Q91YY4 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atpaf2Q91YY4 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms