Protein–RNA interactions for Protein: Q91YR7

Prpf6, Pre-mRNA-processing factor 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 941 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf6Q91YR7 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Prpf6Q91YR7 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Prpf6Q91YR7 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Prpf6Q91YR7 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Prpf6Q91YR7 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Prpf6Q91YR7 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Prpf6Q91YR7 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Prpf6Q91YR7 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Prpf6Q91YR7 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Prpf6Q91YR7 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Prpf6Q91YR7 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Prpf6Q91YR7 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Prpf6Q91YR7 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Prpf6Q91YR7 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Prpf6Q91YR7 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Prpf6Q91YR7 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Prpf6Q91YR7 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Prpf6Q91YR7 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Prpf6Q91YR7 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Prpf6Q91YR7 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Prpf6Q91YR7 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Prpf6Q91YR7 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Prpf6Q91YR7 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Prpf6Q91YR7 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prpf6Q91YR7 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prpf6Q91YR7 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prpf6Q91YR7 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Prpf6Q91YR7 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prpf6Q91YR7 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prpf6Q91YR7 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prpf6Q91YR7 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prpf6Q91YR7 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prpf6Q91YR7 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prpf6Q91YR7 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prpf6Q91YR7 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prpf6Q91YR7 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prpf6Q91YR7 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prpf6Q91YR7 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prpf6Q91YR7 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prpf6Q91YR7 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prpf6Q91YR7 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prpf6Q91YR7 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prpf6Q91YR7 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prpf6Q91YR7 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prpf6Q91YR7 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prpf6Q91YR7 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prpf6Q91YR7 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prpf6Q91YR7 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Prpf6Q91YR7 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Prpf6Q91YR7 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Prpf6Q91YR7 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Prpf6Q91YR7 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Prpf6Q91YR7 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Prpf6Q91YR7 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Prpf6Q91YR7 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Prpf6Q91YR7 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Prpf6Q91YR7 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Prpf6Q91YR7 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Prpf6Q91YR7 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Prpf6Q91YR7 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Prpf6Q91YR7 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Prpf6Q91YR7 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Prpf6Q91YR7 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Prpf6Q91YR7 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Prpf6Q91YR7 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Prpf6Q91YR7 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Prpf6Q91YR7 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Prpf6Q91YR7 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Prpf6Q91YR7 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Prpf6Q91YR7 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Prpf6Q91YR7 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Prpf6Q91YR7 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Prpf6Q91YR7 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Prpf6Q91YR7 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Prpf6Q91YR7 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Prpf6Q91YR7 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Prpf6Q91YR7 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Prpf6Q91YR7 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Prpf6Q91YR7 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Prpf6Q91YR7 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Prpf6Q91YR7 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Prpf6Q91YR7 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Prpf6Q91YR7 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Prpf6Q91YR7 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Prpf6Q91YR7 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Prpf6Q91YR7 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Prpf6Q91YR7 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Prpf6Q91YR7 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Prpf6Q91YR7 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Prpf6Q91YR7 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Prpf6Q91YR7 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Prpf6Q91YR7 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Prpf6Q91YR7 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Prpf6Q91YR7 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Prpf6Q91YR7 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prpf6Q91YR7 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prpf6Q91YR7 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prpf6Q91YR7 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Prpf6Q91YR7 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prpf6Q91YR7 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms