Protein–RNA interactions for Protein: Q91YK0

Lrrc49, Leucine-rich repeat-containing protein 49, mousemouse

Predictions only

Length 686 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc49Q91YK0 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrrc49Q91YK0 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrrc49Q91YK0 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrrc49Q91YK0 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrrc49Q91YK0 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrrc49Q91YK0 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrrc49Q91YK0 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrrc49Q91YK0 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrrc49Q91YK0 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrrc49Q91YK0 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrc49Q91YK0 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrc49Q91YK0 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrc49Q91YK0 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrc49Q91YK0 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrc49Q91YK0 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrc49Q91YK0 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrc49Q91YK0 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrc49Q91YK0 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrc49Q91YK0 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrc49Q91YK0 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrc49Q91YK0 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrc49Q91YK0 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrc49Q91YK0 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrc49Q91YK0 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrc49Q91YK0 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrc49Q91YK0 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrc49Q91YK0 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrc49Q91YK0 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrc49Q91YK0 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrc49Q91YK0 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrc49Q91YK0 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrc49Q91YK0 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrc49Q91YK0 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrc49Q91YK0 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrc49Q91YK0 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrc49Q91YK0 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lrrc49Q91YK0 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lrrc49Q91YK0 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Lrrc49Q91YK0 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lrrc49Q91YK0 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lrrc49Q91YK0 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lrrc49Q91YK0 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lrrc49Q91YK0 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lrrc49Q91YK0 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lrrc49Q91YK0 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lrrc49Q91YK0 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lrrc49Q91YK0 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lrrc49Q91YK0 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lrrc49Q91YK0 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lrrc49Q91YK0 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Lrrc49Q91YK0 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lrrc49Q91YK0 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lrrc49Q91YK0 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lrrc49Q91YK0 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lrrc49Q91YK0 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lrrc49Q91YK0 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lrrc49Q91YK0 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lrrc49Q91YK0 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lrrc49Q91YK0 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lrrc49Q91YK0 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lrrc49Q91YK0 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lrrc49Q91YK0 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lrrc49Q91YK0 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lrrc49Q91YK0 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lrrc49Q91YK0 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrrc49Q91YK0 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrrc49Q91YK0 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrrc49Q91YK0 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrrc49Q91YK0 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrrc49Q91YK0 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrrc49Q91YK0 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrrc49Q91YK0 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrrc49Q91YK0 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrrc49Q91YK0 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrrc49Q91YK0 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrrc49Q91YK0 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrrc49Q91YK0 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrrc49Q91YK0 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrrc49Q91YK0 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrrc49Q91YK0 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrrc49Q91YK0 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrrc49Q91YK0 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrrc49Q91YK0 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrrc49Q91YK0 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrrc49Q91YK0 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrrc49Q91YK0 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrrc49Q91YK0 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrrc49Q91YK0 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrrc49Q91YK0 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrrc49Q91YK0 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrrc49Q91YK0 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrrc49Q91YK0 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrrc49Q91YK0 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrrc49Q91YK0 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrrc49Q91YK0 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrrc49Q91YK0 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrrc49Q91YK0 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrrc49Q91YK0 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrrc49Q91YK0 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrrc49Q91YK0 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms