Protein–RNA interactions for Protein: Q91XV3

Basp1, Brain acid soluble protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Basp1Q91XV3 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Basp1Q91XV3 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Basp1Q91XV3 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Basp1Q91XV3 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Basp1Q91XV3 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Basp1Q91XV3 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Basp1Q91XV3 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Basp1Q91XV3 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Basp1Q91XV3 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Basp1Q91XV3 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Basp1Q91XV3 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Basp1Q91XV3 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Basp1Q91XV3 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Basp1Q91XV3 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Basp1Q91XV3 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Basp1Q91XV3 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Basp1Q91XV3 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Basp1Q91XV3 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Basp1Q91XV3 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Basp1Q91XV3 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Basp1Q91XV3 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Basp1Q91XV3 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Basp1Q91XV3 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Basp1Q91XV3 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Basp1Q91XV3 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Basp1Q91XV3 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Basp1Q91XV3 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Basp1Q91XV3 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Basp1Q91XV3 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Basp1Q91XV3 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Basp1Q91XV3 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Basp1Q91XV3 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Basp1Q91XV3 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Basp1Q91XV3 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Basp1Q91XV3 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Basp1Q91XV3 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Basp1Q91XV3 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Basp1Q91XV3 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Basp1Q91XV3 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Basp1Q91XV3 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Basp1Q91XV3 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Basp1Q91XV3 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Basp1Q91XV3 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Basp1Q91XV3 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Basp1Q91XV3 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Basp1Q91XV3 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Basp1Q91XV3 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Basp1Q91XV3 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Basp1Q91XV3 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Basp1Q91XV3 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Basp1Q91XV3 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Basp1Q91XV3 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Basp1Q91XV3 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Basp1Q91XV3 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Basp1Q91XV3 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Basp1Q91XV3 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Basp1Q91XV3 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Basp1Q91XV3 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Basp1Q91XV3 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Basp1Q91XV3 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Basp1Q91XV3 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Basp1Q91XV3 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Basp1Q91XV3 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Basp1Q91XV3 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Basp1Q91XV3 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Basp1Q91XV3 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Basp1Q91XV3 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Basp1Q91XV3 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Basp1Q91XV3 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Basp1Q91XV3 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Basp1Q91XV3 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Basp1Q91XV3 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Basp1Q91XV3 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Basp1Q91XV3 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Basp1Q91XV3 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Basp1Q91XV3 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Basp1Q91XV3 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Basp1Q91XV3 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Basp1Q91XV3 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Basp1Q91XV3 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Basp1Q91XV3 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Basp1Q91XV3 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Basp1Q91XV3 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Basp1Q91XV3 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Basp1Q91XV3 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Basp1Q91XV3 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Basp1Q91XV3 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Basp1Q91XV3 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Basp1Q91XV3 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Basp1Q91XV3 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Basp1Q91XV3 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Basp1Q91XV3 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Basp1Q91XV3 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Basp1Q91XV3 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Basp1Q91XV3 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Basp1Q91XV3 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Basp1Q91XV3 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Basp1Q91XV3 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Basp1Q91XV3 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Basp1Q91XV3 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms