Protein–RNA interactions for Protein: Q91XD2

Lims2, LIM and senescent cell antigen-like-containing domain protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lims2Q91XD2 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Lims2Q91XD2 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lims2Q91XD2 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Lims2Q91XD2 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lims2Q91XD2 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lims2Q91XD2 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lims2Q91XD2 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lims2Q91XD2 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lims2Q91XD2 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lims2Q91XD2 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lims2Q91XD2 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lims2Q91XD2 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Lims2Q91XD2 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lims2Q91XD2 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lims2Q91XD2 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lims2Q91XD2 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lims2Q91XD2 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lims2Q91XD2 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lims2Q91XD2 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lims2Q91XD2 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lims2Q91XD2 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lims2Q91XD2 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lims2Q91XD2 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lims2Q91XD2 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lims2Q91XD2 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lims2Q91XD2 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lims2Q91XD2 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lims2Q91XD2 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lims2Q91XD2 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Lims2Q91XD2 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lims2Q91XD2 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lims2Q91XD2 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lims2Q91XD2 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lims2Q91XD2 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lims2Q91XD2 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lims2Q91XD2 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lims2Q91XD2 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lims2Q91XD2 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lims2Q91XD2 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lims2Q91XD2 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lims2Q91XD2 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lims2Q91XD2 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lims2Q91XD2 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lims2Q91XD2 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lims2Q91XD2 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lims2Q91XD2 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lims2Q91XD2 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lims2Q91XD2 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Lims2Q91XD2 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lims2Q91XD2 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lims2Q91XD2 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lims2Q91XD2 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lims2Q91XD2 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lims2Q91XD2 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lims2Q91XD2 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lims2Q91XD2 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lims2Q91XD2 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lims2Q91XD2 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lims2Q91XD2 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lims2Q91XD2 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lims2Q91XD2 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lims2Q91XD2 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lims2Q91XD2 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lims2Q91XD2 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lims2Q91XD2 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lims2Q91XD2 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lims2Q91XD2 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Lims2Q91XD2 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lims2Q91XD2 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lims2Q91XD2 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lims2Q91XD2 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lims2Q91XD2 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lims2Q91XD2 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lims2Q91XD2 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lims2Q91XD2 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lims2Q91XD2 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lims2Q91XD2 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lims2Q91XD2 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lims2Q91XD2 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lims2Q91XD2 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lims2Q91XD2 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lims2Q91XD2 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
Lims2Q91XD2 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Lims2Q91XD2 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Lims2Q91XD2 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lims2Q91XD2 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lims2Q91XD2 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lims2Q91XD2 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lims2Q91XD2 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lims2Q91XD2 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lims2Q91XD2 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lims2Q91XD2 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lims2Q91XD2 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lims2Q91XD2 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lims2Q91XD2 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lims2Q91XD2 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lims2Q91XD2 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lims2Q91XD2 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lims2Q91XD2 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Lims2Q91XD2 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms