Protein–RNA interactions for Protein: Q91W78

Usb1, U6 snRNA phosphodiesterase, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usb1Q91W78 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usb1Q91W78 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usb1Q91W78 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usb1Q91W78 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usb1Q91W78 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usb1Q91W78 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usb1Q91W78 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usb1Q91W78 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usb1Q91W78 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usb1Q91W78 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usb1Q91W78 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usb1Q91W78 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Usb1Q91W78 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usb1Q91W78 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usb1Q91W78 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usb1Q91W78 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usb1Q91W78 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Usb1Q91W78 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usb1Q91W78 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usb1Q91W78 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usb1Q91W78 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usb1Q91W78 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usb1Q91W78 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usb1Q91W78 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usb1Q91W78 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usb1Q91W78 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usb1Q91W78 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usb1Q91W78 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usb1Q91W78 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usb1Q91W78 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usb1Q91W78 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usb1Q91W78 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usb1Q91W78 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usb1Q91W78 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usb1Q91W78 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usb1Q91W78 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usb1Q91W78 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usb1Q91W78 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usb1Q91W78 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usb1Q91W78 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Usb1Q91W78 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usb1Q91W78 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usb1Q91W78 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usb1Q91W78 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usb1Q91W78 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usb1Q91W78 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usb1Q91W78 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usb1Q91W78 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usb1Q91W78 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usb1Q91W78 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usb1Q91W78 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usb1Q91W78 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usb1Q91W78 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usb1Q91W78 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usb1Q91W78 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usb1Q91W78 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usb1Q91W78 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usb1Q91W78 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usb1Q91W78 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Usb1Q91W78 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usb1Q91W78 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usb1Q91W78 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usb1Q91W78 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usb1Q91W78 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usb1Q91W78 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usb1Q91W78 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usb1Q91W78 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usb1Q91W78 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usb1Q91W78 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usb1Q91W78 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usb1Q91W78 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usb1Q91W78 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usb1Q91W78 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usb1Q91W78 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usb1Q91W78 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usb1Q91W78 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usb1Q91W78 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usb1Q91W78 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usb1Q91W78 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usb1Q91W78 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usb1Q91W78 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usb1Q91W78 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usb1Q91W78 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usb1Q91W78 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usb1Q91W78 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usb1Q91W78 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usb1Q91W78 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usb1Q91W78 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usb1Q91W78 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usb1Q91W78 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Usb1Q91W78 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Usb1Q91W78 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usb1Q91W78 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usb1Q91W78 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usb1Q91W78 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usb1Q91W78 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usb1Q91W78 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usb1Q91W78 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Usb1Q91W78 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Usb1Q91W78 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms