Protein–RNA interactions for Protein: Q91W50

Csde1, Cold shock domain-containing protein E1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csde1Q91W50 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Csde1Q91W50 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Csde1Q91W50 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Csde1Q91W50 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Csde1Q91W50 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Csde1Q91W50 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Csde1Q91W50 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Csde1Q91W50 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Csde1Q91W50 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Csde1Q91W50 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Csde1Q91W50 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Csde1Q91W50 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Csde1Q91W50 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Csde1Q91W50 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Csde1Q91W50 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Csde1Q91W50 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Csde1Q91W50 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Csde1Q91W50 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Csde1Q91W50 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Csde1Q91W50 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Csde1Q91W50 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Csde1Q91W50 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Csde1Q91W50 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Csde1Q91W50 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Csde1Q91W50 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Csde1Q91W50 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Csde1Q91W50 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Csde1Q91W50 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Csde1Q91W50 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Csde1Q91W50 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Csde1Q91W50 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Csde1Q91W50 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Csde1Q91W50 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Csde1Q91W50 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Csde1Q91W50 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Csde1Q91W50 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Csde1Q91W50 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Csde1Q91W50 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Csde1Q91W50 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Csde1Q91W50 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Csde1Q91W50 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Csde1Q91W50 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Csde1Q91W50 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Csde1Q91W50 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Csde1Q91W50 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Csde1Q91W50 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Csde1Q91W50 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Csde1Q91W50 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Csde1Q91W50 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Csde1Q91W50 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Csde1Q91W50 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Csde1Q91W50 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Csde1Q91W50 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Csde1Q91W50 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Csde1Q91W50 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Csde1Q91W50 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Csde1Q91W50 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Csde1Q91W50 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Csde1Q91W50 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Csde1Q91W50 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Csde1Q91W50 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Csde1Q91W50 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Csde1Q91W50 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Csde1Q91W50 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Csde1Q91W50 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Csde1Q91W50 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Csde1Q91W50 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Csde1Q91W50 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Csde1Q91W50 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Csde1Q91W50 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Csde1Q91W50 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Csde1Q91W50 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Csde1Q91W50 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Csde1Q91W50 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Csde1Q91W50 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Csde1Q91W50 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Csde1Q91W50 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Csde1Q91W50 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Csde1Q91W50 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Csde1Q91W50 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Csde1Q91W50 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Csde1Q91W50 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Csde1Q91W50 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Csde1Q91W50 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Csde1Q91W50 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Csde1Q91W50 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Csde1Q91W50 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Csde1Q91W50 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Csde1Q91W50 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Csde1Q91W50 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Csde1Q91W50 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Csde1Q91W50 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Csde1Q91W50 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Csde1Q91W50 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Csde1Q91W50 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Csde1Q91W50 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Csde1Q91W50 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Csde1Q91W50 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Csde1Q91W50 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Csde1Q91W50 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms