Protein–RNA interactions for Protein: Q91W36

Usp3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp3Q91W36 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Usp3Q91W36 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Usp3Q91W36 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Usp3Q91W36 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Usp3Q91W36 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Usp3Q91W36 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Usp3Q91W36 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Usp3Q91W36 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Usp3Q91W36 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Usp3Q91W36 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Usp3Q91W36 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp3Q91W36 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp3Q91W36 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp3Q91W36 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp3Q91W36 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp3Q91W36 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp3Q91W36 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp3Q91W36 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp3Q91W36 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp3Q91W36 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp3Q91W36 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp3Q91W36 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp3Q91W36 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp3Q91W36 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp3Q91W36 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp3Q91W36 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp3Q91W36 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp3Q91W36 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp3Q91W36 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp3Q91W36 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp3Q91W36 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp3Q91W36 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp3Q91W36 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp3Q91W36 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp3Q91W36 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp3Q91W36 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp3Q91W36 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp3Q91W36 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp3Q91W36 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp3Q91W36 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp3Q91W36 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp3Q91W36 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp3Q91W36 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp3Q91W36 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp3Q91W36 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp3Q91W36 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp3Q91W36 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp3Q91W36 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp3Q91W36 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp3Q91W36 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp3Q91W36 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp3Q91W36 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp3Q91W36 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp3Q91W36 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp3Q91W36 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp3Q91W36 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp3Q91W36 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp3Q91W36 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp3Q91W36 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp3Q91W36 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp3Q91W36 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp3Q91W36 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp3Q91W36 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp3Q91W36 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp3Q91W36 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp3Q91W36 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp3Q91W36 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp3Q91W36 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp3Q91W36 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp3Q91W36 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp3Q91W36 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp3Q91W36 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp3Q91W36 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp3Q91W36 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp3Q91W36 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp3Q91W36 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp3Q91W36 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp3Q91W36 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp3Q91W36 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp3Q91W36 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp3Q91W36 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp3Q91W36 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp3Q91W36 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp3Q91W36 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp3Q91W36 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp3Q91W36 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp3Q91W36 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp3Q91W36 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp3Q91W36 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp3Q91W36 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp3Q91W36 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Usp3Q91W36 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Usp3Q91W36 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Usp3Q91W36 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Usp3Q91W36 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Usp3Q91W36 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Usp3Q91W36 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Usp3Q91W36 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Usp3Q91W36 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Usp3Q91W36 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms