Protein–RNA interactions for Protein: Q91VH2

Snx9, Sorting nexin-9, mousemouse

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx9Q91VH2 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Snx9Q91VH2 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Snx9Q91VH2 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Snx9Q91VH2 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Snx9Q91VH2 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Snx9Q91VH2 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Snx9Q91VH2 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Snx9Q91VH2 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Snx9Q91VH2 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Snx9Q91VH2 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Snx9Q91VH2 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Snx9Q91VH2 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Snx9Q91VH2 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Snx9Q91VH2 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Snx9Q91VH2 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Snx9Q91VH2 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Snx9Q91VH2 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Snx9Q91VH2 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Snx9Q91VH2 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Snx9Q91VH2 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Snx9Q91VH2 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Snx9Q91VH2 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Snx9Q91VH2 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Snx9Q91VH2 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Snx9Q91VH2 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Snx9Q91VH2 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Snx9Q91VH2 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Snx9Q91VH2 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Snx9Q91VH2 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Snx9Q91VH2 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Snx9Q91VH2 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Snx9Q91VH2 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Snx9Q91VH2 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Snx9Q91VH2 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Snx9Q91VH2 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Snx9Q91VH2 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Snx9Q91VH2 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Snx9Q91VH2 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Snx9Q91VH2 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Snx9Q91VH2 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Snx9Q91VH2 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Snx9Q91VH2 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Snx9Q91VH2 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Snx9Q91VH2 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Snx9Q91VH2 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Snx9Q91VH2 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Snx9Q91VH2 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Snx9Q91VH2 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Snx9Q91VH2 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Snx9Q91VH2 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Snx9Q91VH2 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Snx9Q91VH2 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Snx9Q91VH2 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Snx9Q91VH2 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Snx9Q91VH2 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Snx9Q91VH2 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snx9Q91VH2 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snx9Q91VH2 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snx9Q91VH2 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snx9Q91VH2 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snx9Q91VH2 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snx9Q91VH2 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snx9Q91VH2 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snx9Q91VH2 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snx9Q91VH2 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snx9Q91VH2 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snx9Q91VH2 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snx9Q91VH2 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snx9Q91VH2 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snx9Q91VH2 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snx9Q91VH2 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snx9Q91VH2 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snx9Q91VH2 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snx9Q91VH2 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snx9Q91VH2 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snx9Q91VH2 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snx9Q91VH2 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snx9Q91VH2 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snx9Q91VH2 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snx9Q91VH2 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snx9Q91VH2 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snx9Q91VH2 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snx9Q91VH2 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snx9Q91VH2 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snx9Q91VH2 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snx9Q91VH2 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snx9Q91VH2 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snx9Q91VH2 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snx9Q91VH2 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snx9Q91VH2 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snx9Q91VH2 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snx9Q91VH2 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snx9Q91VH2 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snx9Q91VH2 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snx9Q91VH2 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snx9Q91VH2 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snx9Q91VH2 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Snx9Q91VH2 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snx9Q91VH2 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snx9Q91VH2 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms