Protein–RNA interactions for Protein: Q91VE6

Nifk, MKI67 FHA domain-interacting nucleolar phosphoprotein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NifkQ91VE6 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NifkQ91VE6 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NifkQ91VE6 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NifkQ91VE6 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NifkQ91VE6 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NifkQ91VE6 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NifkQ91VE6 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NifkQ91VE6 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NifkQ91VE6 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NifkQ91VE6 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NifkQ91VE6 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NifkQ91VE6 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NifkQ91VE6 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NifkQ91VE6 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NifkQ91VE6 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NifkQ91VE6 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NifkQ91VE6 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NifkQ91VE6 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NifkQ91VE6 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
NifkQ91VE6 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NifkQ91VE6 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NifkQ91VE6 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NifkQ91VE6 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NifkQ91VE6 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NifkQ91VE6 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NifkQ91VE6 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NifkQ91VE6 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NifkQ91VE6 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NifkQ91VE6 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NifkQ91VE6 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NifkQ91VE6 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NifkQ91VE6 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NifkQ91VE6 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NifkQ91VE6 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NifkQ91VE6 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NifkQ91VE6 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NifkQ91VE6 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NifkQ91VE6 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NifkQ91VE6 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NifkQ91VE6 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NifkQ91VE6 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NifkQ91VE6 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NifkQ91VE6 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NifkQ91VE6 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NifkQ91VE6 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NifkQ91VE6 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
NifkQ91VE6 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NifkQ91VE6 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
NifkQ91VE6 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
NifkQ91VE6 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NifkQ91VE6 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NifkQ91VE6 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NifkQ91VE6 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NifkQ91VE6 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NifkQ91VE6 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NifkQ91VE6 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NifkQ91VE6 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NifkQ91VE6 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NifkQ91VE6 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NifkQ91VE6 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NifkQ91VE6 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NifkQ91VE6 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NifkQ91VE6 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NifkQ91VE6 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NifkQ91VE6 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NifkQ91VE6 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NifkQ91VE6 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NifkQ91VE6 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NifkQ91VE6 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NifkQ91VE6 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NifkQ91VE6 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NifkQ91VE6 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NifkQ91VE6 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NifkQ91VE6 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NifkQ91VE6 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
NifkQ91VE6 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NifkQ91VE6 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NifkQ91VE6 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NifkQ91VE6 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NifkQ91VE6 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
NifkQ91VE6 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NifkQ91VE6 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NifkQ91VE6 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NifkQ91VE6 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NifkQ91VE6 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NifkQ91VE6 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NifkQ91VE6 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NifkQ91VE6 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NifkQ91VE6 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
NifkQ91VE6 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NifkQ91VE6 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NifkQ91VE6 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NifkQ91VE6 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NifkQ91VE6 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NifkQ91VE6 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NifkQ91VE6 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NifkQ91VE6 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NifkQ91VE6 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NifkQ91VE6 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NifkQ91VE6 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms