Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHC3

Selenom, Selenoprotein M, mousemouse

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SelenomQ8VHC3 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SelenomQ8VHC3 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SelenomQ8VHC3 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SelenomQ8VHC3 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SelenomQ8VHC3 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SelenomQ8VHC3 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SelenomQ8VHC3 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SelenomQ8VHC3 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SelenomQ8VHC3 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SelenomQ8VHC3 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SelenomQ8VHC3 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SelenomQ8VHC3 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SelenomQ8VHC3 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SelenomQ8VHC3 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SelenomQ8VHC3 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SelenomQ8VHC3 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SelenomQ8VHC3 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SelenomQ8VHC3 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SelenomQ8VHC3 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SelenomQ8VHC3 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SelenomQ8VHC3 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SelenomQ8VHC3 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SelenomQ8VHC3 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SelenomQ8VHC3 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SelenomQ8VHC3 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SelenomQ8VHC3 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SelenomQ8VHC3 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SelenomQ8VHC3 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SelenomQ8VHC3 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SelenomQ8VHC3 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SelenomQ8VHC3 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SelenomQ8VHC3 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SelenomQ8VHC3 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SelenomQ8VHC3 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SelenomQ8VHC3 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SelenomQ8VHC3 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SelenomQ8VHC3 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SelenomQ8VHC3 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SelenomQ8VHC3 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SelenomQ8VHC3 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SelenomQ8VHC3 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SelenomQ8VHC3 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SelenomQ8VHC3 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SelenomQ8VHC3 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SelenomQ8VHC3 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SelenomQ8VHC3 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SelenomQ8VHC3 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SelenomQ8VHC3 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SelenomQ8VHC3 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SelenomQ8VHC3 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SelenomQ8VHC3 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SelenomQ8VHC3 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SelenomQ8VHC3 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SelenomQ8VHC3 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SelenomQ8VHC3 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SelenomQ8VHC3 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SelenomQ8VHC3 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SelenomQ8VHC3 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SelenomQ8VHC3 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SelenomQ8VHC3 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SelenomQ8VHC3 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SelenomQ8VHC3 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SelenomQ8VHC3 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SelenomQ8VHC3 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SelenomQ8VHC3 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SelenomQ8VHC3 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SelenomQ8VHC3 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SelenomQ8VHC3 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SelenomQ8VHC3 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SelenomQ8VHC3 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SelenomQ8VHC3 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SelenomQ8VHC3 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SelenomQ8VHC3 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SelenomQ8VHC3 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SelenomQ8VHC3 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SelenomQ8VHC3 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SelenomQ8VHC3 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SelenomQ8VHC3 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SelenomQ8VHC3 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SelenomQ8VHC3 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SelenomQ8VHC3 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SelenomQ8VHC3 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SelenomQ8VHC3 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SelenomQ8VHC3 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SelenomQ8VHC3 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SelenomQ8VHC3 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SelenomQ8VHC3 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SelenomQ8VHC3 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SelenomQ8VHC3 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SelenomQ8VHC3 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SelenomQ8VHC3 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SelenomQ8VHC3 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SelenomQ8VHC3 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SelenomQ8VHC3 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SelenomQ8VHC3 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SelenomQ8VHC3 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SelenomQ8VHC3 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SelenomQ8VHC3 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SelenomQ8VHC3 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SelenomQ8VHC3 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms