Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEJ9

Vps4a, Vacuolar protein sorting-associated protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps4aQ8VEJ9 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vps4aQ8VEJ9 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vps4aQ8VEJ9 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vps4aQ8VEJ9 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vps4aQ8VEJ9 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vps4aQ8VEJ9 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vps4aQ8VEJ9 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vps4aQ8VEJ9 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vps4aQ8VEJ9 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vps4aQ8VEJ9 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vps4aQ8VEJ9 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vps4aQ8VEJ9 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vps4aQ8VEJ9 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vps4aQ8VEJ9 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vps4aQ8VEJ9 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vps4aQ8VEJ9 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vps4aQ8VEJ9 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vps4aQ8VEJ9 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vps4aQ8VEJ9 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vps4aQ8VEJ9 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vps4aQ8VEJ9 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vps4aQ8VEJ9 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vps4aQ8VEJ9 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vps4aQ8VEJ9 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vps4aQ8VEJ9 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vps4aQ8VEJ9 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vps4aQ8VEJ9 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vps4aQ8VEJ9 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vps4aQ8VEJ9 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Vps4aQ8VEJ9 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vps4aQ8VEJ9 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vps4aQ8VEJ9 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vps4aQ8VEJ9 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vps4aQ8VEJ9 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vps4aQ8VEJ9 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vps4aQ8VEJ9 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vps4aQ8VEJ9 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vps4aQ8VEJ9 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vps4aQ8VEJ9 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vps4aQ8VEJ9 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vps4aQ8VEJ9 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vps4aQ8VEJ9 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vps4aQ8VEJ9 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vps4aQ8VEJ9 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vps4aQ8VEJ9 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vps4aQ8VEJ9 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Vps4aQ8VEJ9 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vps4aQ8VEJ9 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vps4aQ8VEJ9 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vps4aQ8VEJ9 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vps4aQ8VEJ9 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vps4aQ8VEJ9 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vps4aQ8VEJ9 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vps4aQ8VEJ9 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vps4aQ8VEJ9 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vps4aQ8VEJ9 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vps4aQ8VEJ9 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vps4aQ8VEJ9 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vps4aQ8VEJ9 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vps4aQ8VEJ9 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vps4aQ8VEJ9 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vps4aQ8VEJ9 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vps4aQ8VEJ9 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vps4aQ8VEJ9 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vps4aQ8VEJ9 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vps4aQ8VEJ9 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vps4aQ8VEJ9 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vps4aQ8VEJ9 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vps4aQ8VEJ9 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vps4aQ8VEJ9 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vps4aQ8VEJ9 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vps4aQ8VEJ9 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vps4aQ8VEJ9 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vps4aQ8VEJ9 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vps4aQ8VEJ9 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Vps4aQ8VEJ9 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Vps4aQ8VEJ9 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vps4aQ8VEJ9 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vps4aQ8VEJ9 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vps4aQ8VEJ9 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vps4aQ8VEJ9 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vps4aQ8VEJ9 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vps4aQ8VEJ9 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vps4aQ8VEJ9 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vps4aQ8VEJ9 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vps4aQ8VEJ9 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vps4aQ8VEJ9 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vps4aQ8VEJ9 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vps4aQ8VEJ9 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vps4aQ8VEJ9 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vps4aQ8VEJ9 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vps4aQ8VEJ9 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vps4aQ8VEJ9 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vps4aQ8VEJ9 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vps4aQ8VEJ9 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vps4aQ8VEJ9 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vps4aQ8VEJ9 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vps4aQ8VEJ9 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vps4aQ8VEJ9 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vps4aQ8VEJ9 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms