Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE62

Paip1, Polyadenylate-binding protein-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Paip1Q8VE62 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Paip1Q8VE62 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Paip1Q8VE62 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Paip1Q8VE62 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Paip1Q8VE62 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Paip1Q8VE62 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Paip1Q8VE62 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Paip1Q8VE62 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Paip1Q8VE62 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Paip1Q8VE62 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Paip1Q8VE62 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Paip1Q8VE62 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Paip1Q8VE62 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Paip1Q8VE62 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Paip1Q8VE62 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Paip1Q8VE62 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Paip1Q8VE62 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Paip1Q8VE62 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Paip1Q8VE62 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Paip1Q8VE62 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Paip1Q8VE62 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Paip1Q8VE62 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Paip1Q8VE62 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Paip1Q8VE62 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Paip1Q8VE62 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Paip1Q8VE62 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Paip1Q8VE62 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Paip1Q8VE62 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Paip1Q8VE62 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Paip1Q8VE62 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Paip1Q8VE62 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Paip1Q8VE62 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Paip1Q8VE62 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Paip1Q8VE62 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Paip1Q8VE62 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Paip1Q8VE62 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Paip1Q8VE62 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.07■□□□□ 0
Paip1Q8VE62 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Paip1Q8VE62 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Paip1Q8VE62 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Paip1Q8VE62 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Paip1Q8VE62 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Paip1Q8VE62 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Paip1Q8VE62 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Paip1Q8VE62 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Paip1Q8VE62 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Paip1Q8VE62 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Paip1Q8VE62 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Paip1Q8VE62 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Paip1Q8VE62 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Paip1Q8VE62 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Paip1Q8VE62 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Paip1Q8VE62 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Paip1Q8VE62 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Paip1Q8VE62 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Paip1Q8VE62 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Paip1Q8VE62 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Paip1Q8VE62 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Paip1Q8VE62 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Paip1Q8VE62 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Paip1Q8VE62 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Paip1Q8VE62 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Paip1Q8VE62 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Paip1Q8VE62 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Paip1Q8VE62 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Paip1Q8VE62 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Paip1Q8VE62 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Paip1Q8VE62 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Paip1Q8VE62 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Paip1Q8VE62 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Paip1Q8VE62 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Paip1Q8VE62 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Paip1Q8VE62 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Paip1Q8VE62 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Paip1Q8VE62 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Paip1Q8VE62 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Paip1Q8VE62 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Paip1Q8VE62 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Paip1Q8VE62 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Paip1Q8VE62 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Paip1Q8VE62 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Paip1Q8VE62 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Paip1Q8VE62 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Paip1Q8VE62 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Paip1Q8VE62 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Paip1Q8VE62 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
Paip1Q8VE62 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Paip1Q8VE62 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Paip1Q8VE62 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Paip1Q8VE62 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Paip1Q8VE62 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Paip1Q8VE62 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Paip1Q8VE62 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Paip1Q8VE62 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Paip1Q8VE62 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Paip1Q8VE62 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Paip1Q8VE62 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Paip1Q8VE62 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Paip1Q8VE62 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Paip1Q8VE62 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms