Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDS8

Stx18, Syntaxin-18, mousemouse

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Length 334 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx18Q8VDS8 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
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Stx18Q8VDS8 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Stx18Q8VDS8 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Stx18Q8VDS8 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Stx18Q8VDS8 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Stx18Q8VDS8 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Stx18Q8VDS8 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Stx18Q8VDS8 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Stx18Q8VDS8 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Stx18Q8VDS8 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Stx18Q8VDS8 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Stx18Q8VDS8 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Stx18Q8VDS8 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Stx18Q8VDS8 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Stx18Q8VDS8 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Stx18Q8VDS8 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
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Stx18Q8VDS8 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Stx18Q8VDS8 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
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Stx18Q8VDS8 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Stx18Q8VDS8 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Stx18Q8VDS8 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Stx18Q8VDS8 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Stx18Q8VDS8 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Stx18Q8VDS8 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Stx18Q8VDS8 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
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Stx18Q8VDS8 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Stx18Q8VDS8 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Stx18Q8VDS8 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
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Stx18Q8VDS8 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
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Stx18Q8VDS8 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
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Stx18Q8VDS8 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
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Stx18Q8VDS8 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
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Stx18Q8VDS8 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
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Stx18Q8VDS8 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Stx18Q8VDS8 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
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Stx18Q8VDS8 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
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Stx18Q8VDS8 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Stx18Q8VDS8 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Stx18Q8VDS8 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Stx18Q8VDS8 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Stx18Q8VDS8 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Stx18Q8VDS8 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Stx18Q8VDS8 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Stx18Q8VDS8 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Stx18Q8VDS8 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Stx18Q8VDS8 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Stx18Q8VDS8 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Stx18Q8VDS8 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Stx18Q8VDS8 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Stx18Q8VDS8 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Stx18Q8VDS8 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Stx18Q8VDS8 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Stx18Q8VDS8 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Stx18Q8VDS8 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Stx18Q8VDS8 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Stx18Q8VDS8 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Stx18Q8VDS8 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms