Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCE4

Uncharacterized protein C9orf40 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 163 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8VCE4 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Q8VCE4 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Q8VCE4 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Q8VCE4 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Q8VCE4 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Q8VCE4 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Q8VCE4 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Q8VCE4 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Q8VCE4 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Q8VCE4 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Q8VCE4 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Q8VCE4 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Q8VCE4 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Q8VCE4 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Q8VCE4 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Q8VCE4 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Q8VCE4 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Q8VCE4 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Q8VCE4 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Q8VCE4 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Q8VCE4 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Q8VCE4 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Q8VCE4 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Q8VCE4 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Q8VCE4 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Q8VCE4 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Q8VCE4 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Q8VCE4 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Q8VCE4 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Q8VCE4 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Q8VCE4 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Q8VCE4 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Q8VCE4 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Q8VCE4 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Q8VCE4 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Q8VCE4 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Q8VCE4 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Q8VCE4 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Q8VCE4 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Q8VCE4 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Q8VCE4 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Q8VCE4 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Q8VCE4 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q8VCE4 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q8VCE4 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q8VCE4 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q8VCE4 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q8VCE4 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q8VCE4 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q8VCE4 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q8VCE4 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q8VCE4 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q8VCE4 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q8VCE4 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Q8VCE4 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Q8VCE4 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q8VCE4 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q8VCE4 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q8VCE4 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q8VCE4 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q8VCE4 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q8VCE4 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q8VCE4 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q8VCE4 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q8VCE4 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q8VCE4 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q8VCE4 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q8VCE4 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q8VCE4 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q8VCE4 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q8VCE4 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q8VCE4 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q8VCE4 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q8VCE4 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q8VCE4 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q8VCE4 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Q8VCE4 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q8VCE4 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q8VCE4 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q8VCE4 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q8VCE4 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q8VCE4 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q8VCE4 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q8VCE4 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q8VCE4 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Q8VCE4 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q8VCE4 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q8VCE4 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q8VCE4 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q8VCE4 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q8VCE4 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q8VCE4 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q8VCE4 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q8VCE4 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q8VCE4 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q8VCE4 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q8VCE4 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q8VCE4 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q8VCE4 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q8VCE4 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms