Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCD5

Med17, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 17, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med17Q8VCD5 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Med17Q8VCD5 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Med17Q8VCD5 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Med17Q8VCD5 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Med17Q8VCD5 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Med17Q8VCD5 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Med17Q8VCD5 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Med17Q8VCD5 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Med17Q8VCD5 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Med17Q8VCD5 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Med17Q8VCD5 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Med17Q8VCD5 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Med17Q8VCD5 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Med17Q8VCD5 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Med17Q8VCD5 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Med17Q8VCD5 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Med17Q8VCD5 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Med17Q8VCD5 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Med17Q8VCD5 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Med17Q8VCD5 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Med17Q8VCD5 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Med17Q8VCD5 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Med17Q8VCD5 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Med17Q8VCD5 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Med17Q8VCD5 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Med17Q8VCD5 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Med17Q8VCD5 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Med17Q8VCD5 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Med17Q8VCD5 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Med17Q8VCD5 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Med17Q8VCD5 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Med17Q8VCD5 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Med17Q8VCD5 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Med17Q8VCD5 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Med17Q8VCD5 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Med17Q8VCD5 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Med17Q8VCD5 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Med17Q8VCD5 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Med17Q8VCD5 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Med17Q8VCD5 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Med17Q8VCD5 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Med17Q8VCD5 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Med17Q8VCD5 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Med17Q8VCD5 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Med17Q8VCD5 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Med17Q8VCD5 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Med17Q8VCD5 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Med17Q8VCD5 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Med17Q8VCD5 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Med17Q8VCD5 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Med17Q8VCD5 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Med17Q8VCD5 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Med17Q8VCD5 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Med17Q8VCD5 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Med17Q8VCD5 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Med17Q8VCD5 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Med17Q8VCD5 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Med17Q8VCD5 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Med17Q8VCD5 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Med17Q8VCD5 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Med17Q8VCD5 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Med17Q8VCD5 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Med17Q8VCD5 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Med17Q8VCD5 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Med17Q8VCD5 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Med17Q8VCD5 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Med17Q8VCD5 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Med17Q8VCD5 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Med17Q8VCD5 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Med17Q8VCD5 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Med17Q8VCD5 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Med17Q8VCD5 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Med17Q8VCD5 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Med17Q8VCD5 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Med17Q8VCD5 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Med17Q8VCD5 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Med17Q8VCD5 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Med17Q8VCD5 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Med17Q8VCD5 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Med17Q8VCD5 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Med17Q8VCD5 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Med17Q8VCD5 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Med17Q8VCD5 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Med17Q8VCD5 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Med17Q8VCD5 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Med17Q8VCD5 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Med17Q8VCD5 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Med17Q8VCD5 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Med17Q8VCD5 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Med17Q8VCD5 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Med17Q8VCD5 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Med17Q8VCD5 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Med17Q8VCD5 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Med17Q8VCD5 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Med17Q8VCD5 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Med17Q8VCD5 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Med17Q8VCD5 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Med17Q8VCD5 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Med17Q8VCD5 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Med17Q8VCD5 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms