Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCC8

Rapgef3, Rap guanine nucleotide exchange factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 918 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rapgef3Q8VCC8 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rapgef3Q8VCC8 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Rapgef3Q8VCC8 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rapgef3Q8VCC8 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rapgef3Q8VCC8 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rapgef3Q8VCC8 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rapgef3Q8VCC8 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rapgef3Q8VCC8 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rapgef3Q8VCC8 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rapgef3Q8VCC8 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rapgef3Q8VCC8 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Rapgef3Q8VCC8 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rapgef3Q8VCC8 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rapgef3Q8VCC8 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rapgef3Q8VCC8 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Rapgef3Q8VCC8 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rapgef3Q8VCC8 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rapgef3Q8VCC8 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rapgef3Q8VCC8 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rapgef3Q8VCC8 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Rapgef3Q8VCC8 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rapgef3Q8VCC8 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rapgef3Q8VCC8 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rapgef3Q8VCC8 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rapgef3Q8VCC8 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rapgef3Q8VCC8 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rapgef3Q8VCC8 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rapgef3Q8VCC8 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rapgef3Q8VCC8 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rapgef3Q8VCC8 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Rapgef3Q8VCC8 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rapgef3Q8VCC8 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rapgef3Q8VCC8 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rapgef3Q8VCC8 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rapgef3Q8VCC8 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rapgef3Q8VCC8 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rapgef3Q8VCC8 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rapgef3Q8VCC8 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rapgef3Q8VCC8 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rapgef3Q8VCC8 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rapgef3Q8VCC8 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rapgef3Q8VCC8 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Rapgef3Q8VCC8 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rapgef3Q8VCC8 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rapgef3Q8VCC8 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Rapgef3Q8VCC8 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rapgef3Q8VCC8 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Rapgef3Q8VCC8 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rapgef3Q8VCC8 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rapgef3Q8VCC8 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rapgef3Q8VCC8 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rapgef3Q8VCC8 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rapgef3Q8VCC8 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rapgef3Q8VCC8 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rapgef3Q8VCC8 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rapgef3Q8VCC8 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rapgef3Q8VCC8 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rapgef3Q8VCC8 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rapgef3Q8VCC8 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rapgef3Q8VCC8 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rapgef3Q8VCC8 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Rapgef3Q8VCC8 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Rapgef3Q8VCC8 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Rapgef3Q8VCC8 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rapgef3Q8VCC8 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rapgef3Q8VCC8 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Rapgef3Q8VCC8 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Rapgef3Q8VCC8 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rapgef3Q8VCC8 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rapgef3Q8VCC8 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rapgef3Q8VCC8 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rapgef3Q8VCC8 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rapgef3Q8VCC8 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rapgef3Q8VCC8 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rapgef3Q8VCC8 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rapgef3Q8VCC8 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rapgef3Q8VCC8 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rapgef3Q8VCC8 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rapgef3Q8VCC8 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rapgef3Q8VCC8 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rapgef3Q8VCC8 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rapgef3Q8VCC8 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rapgef3Q8VCC8 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rapgef3Q8VCC8 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rapgef3Q8VCC8 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rapgef3Q8VCC8 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rapgef3Q8VCC8 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Rapgef3Q8VCC8 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rapgef3Q8VCC8 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Rapgef3Q8VCC8 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Rapgef3Q8VCC8 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rapgef3Q8VCC8 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rapgef3Q8VCC8 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rapgef3Q8VCC8 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Rapgef3Q8VCC8 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rapgef3Q8VCC8 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rapgef3Q8VCC8 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rapgef3Q8VCC8 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rapgef3Q8VCC8 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Rapgef3Q8VCC8 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms