Protein–RNA interactions for Protein: Q8VBW8

Ttc36, Tetratricopeptide repeat protein 36, mousemouse

Predictions only

Length 186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc36Q8VBW8 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ttc36Q8VBW8 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ttc36Q8VBW8 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ttc36Q8VBW8 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ttc36Q8VBW8 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ttc36Q8VBW8 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ttc36Q8VBW8 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ttc36Q8VBW8 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ttc36Q8VBW8 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ttc36Q8VBW8 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ttc36Q8VBW8 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ttc36Q8VBW8 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ttc36Q8VBW8 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ttc36Q8VBW8 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ttc36Q8VBW8 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ttc36Q8VBW8 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ttc36Q8VBW8 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ttc36Q8VBW8 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ttc36Q8VBW8 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ttc36Q8VBW8 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ttc36Q8VBW8 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ttc36Q8VBW8 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ttc36Q8VBW8 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ttc36Q8VBW8 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ttc36Q8VBW8 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ttc36Q8VBW8 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ttc36Q8VBW8 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Ttc36Q8VBW8 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ttc36Q8VBW8 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ttc36Q8VBW8 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ttc36Q8VBW8 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ttc36Q8VBW8 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ttc36Q8VBW8 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ttc36Q8VBW8 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ttc36Q8VBW8 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ttc36Q8VBW8 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ttc36Q8VBW8 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ttc36Q8VBW8 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ttc36Q8VBW8 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ttc36Q8VBW8 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ttc36Q8VBW8 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ttc36Q8VBW8 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ttc36Q8VBW8 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ttc36Q8VBW8 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ttc36Q8VBW8 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ttc36Q8VBW8 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ttc36Q8VBW8 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ttc36Q8VBW8 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ttc36Q8VBW8 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ttc36Q8VBW8 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ttc36Q8VBW8 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Ttc36Q8VBW8 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ttc36Q8VBW8 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ttc36Q8VBW8 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ttc36Q8VBW8 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ttc36Q8VBW8 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ttc36Q8VBW8 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ttc36Q8VBW8 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ttc36Q8VBW8 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ttc36Q8VBW8 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ttc36Q8VBW8 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ttc36Q8VBW8 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ttc36Q8VBW8 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
Ttc36Q8VBW8 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ttc36Q8VBW8 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ttc36Q8VBW8 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ttc36Q8VBW8 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ttc36Q8VBW8 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ttc36Q8VBW8 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ttc36Q8VBW8 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ttc36Q8VBW8 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ttc36Q8VBW8 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ttc36Q8VBW8 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ttc36Q8VBW8 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ttc36Q8VBW8 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ttc36Q8VBW8 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ttc36Q8VBW8 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ttc36Q8VBW8 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Ttc36Q8VBW8 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ttc36Q8VBW8 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Ttc36Q8VBW8 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ttc36Q8VBW8 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ttc36Q8VBW8 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ttc36Q8VBW8 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ttc36Q8VBW8 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ttc36Q8VBW8 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ttc36Q8VBW8 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ttc36Q8VBW8 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ttc36Q8VBW8 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ttc36Q8VBW8 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ttc36Q8VBW8 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ttc36Q8VBW8 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ttc36Q8VBW8 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ttc36Q8VBW8 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ttc36Q8VBW8 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ttc36Q8VBW8 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ttc36Q8VBW8 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ttc36Q8VBW8 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ttc36Q8VBW8 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ttc36Q8VBW8 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms