Protein–RNA interactions for Protein: Q8VBV7

Cops8, COP9 signalosome complex subunit 8, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops8Q8VBV7 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cops8Q8VBV7 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cops8Q8VBV7 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cops8Q8VBV7 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cops8Q8VBV7 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cops8Q8VBV7 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Cops8Q8VBV7 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cops8Q8VBV7 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cops8Q8VBV7 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Cops8Q8VBV7 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cops8Q8VBV7 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cops8Q8VBV7 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cops8Q8VBV7 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cops8Q8VBV7 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cops8Q8VBV7 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cops8Q8VBV7 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cops8Q8VBV7 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cops8Q8VBV7 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cops8Q8VBV7 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cops8Q8VBV7 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cops8Q8VBV7 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cops8Q8VBV7 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cops8Q8VBV7 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cops8Q8VBV7 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cops8Q8VBV7 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cops8Q8VBV7 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cops8Q8VBV7 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cops8Q8VBV7 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cops8Q8VBV7 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Cops8Q8VBV7 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cops8Q8VBV7 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cops8Q8VBV7 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cops8Q8VBV7 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Cops8Q8VBV7 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cops8Q8VBV7 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cops8Q8VBV7 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cops8Q8VBV7 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cops8Q8VBV7 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cops8Q8VBV7 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cops8Q8VBV7 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cops8Q8VBV7 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cops8Q8VBV7 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cops8Q8VBV7 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cops8Q8VBV7 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cops8Q8VBV7 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cops8Q8VBV7 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cops8Q8VBV7 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cops8Q8VBV7 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cops8Q8VBV7 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cops8Q8VBV7 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cops8Q8VBV7 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cops8Q8VBV7 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cops8Q8VBV7 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cops8Q8VBV7 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cops8Q8VBV7 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cops8Q8VBV7 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cops8Q8VBV7 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cops8Q8VBV7 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cops8Q8VBV7 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cops8Q8VBV7 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cops8Q8VBV7 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cops8Q8VBV7 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cops8Q8VBV7 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cops8Q8VBV7 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cops8Q8VBV7 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cops8Q8VBV7 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cops8Q8VBV7 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Cops8Q8VBV7 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cops8Q8VBV7 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cops8Q8VBV7 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cops8Q8VBV7 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cops8Q8VBV7 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cops8Q8VBV7 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cops8Q8VBV7 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cops8Q8VBV7 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cops8Q8VBV7 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cops8Q8VBV7 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cops8Q8VBV7 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cops8Q8VBV7 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cops8Q8VBV7 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cops8Q8VBV7 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cops8Q8VBV7 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cops8Q8VBV7 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cops8Q8VBV7 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cops8Q8VBV7 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cops8Q8VBV7 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cops8Q8VBV7 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cops8Q8VBV7 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cops8Q8VBV7 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cops8Q8VBV7 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cops8Q8VBV7 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cops8Q8VBV7 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cops8Q8VBV7 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cops8Q8VBV7 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cops8Q8VBV7 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cops8Q8VBV7 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cops8Q8VBV7 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cops8Q8VBV7 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cops8Q8VBV7 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cops8Q8VBV7 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms