Protein–RNA interactions for Protein: Q8R3Q6

Ccdc58, Coiled-coil domain-containing protein 58, mousemouse

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Length 144 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc58Q8R3Q6 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc58Q8R3Q6 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc58Q8R3Q6 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc58Q8R3Q6 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc58Q8R3Q6 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc58Q8R3Q6 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc58Q8R3Q6 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc58Q8R3Q6 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc58Q8R3Q6 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc58Q8R3Q6 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc58Q8R3Q6 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc58Q8R3Q6 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc58Q8R3Q6 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc58Q8R3Q6 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc58Q8R3Q6 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc58Q8R3Q6 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc58Q8R3Q6 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ccdc58Q8R3Q6 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ccdc58Q8R3Q6 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ccdc58Q8R3Q6 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ccdc58Q8R3Q6 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ccdc58Q8R3Q6 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc58Q8R3Q6 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc58Q8R3Q6 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc58Q8R3Q6 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc58Q8R3Q6 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc58Q8R3Q6 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc58Q8R3Q6 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc58Q8R3Q6 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc58Q8R3Q6 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Ccdc58Q8R3Q6 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc58Q8R3Q6 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc58Q8R3Q6 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc58Q8R3Q6 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc58Q8R3Q6 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc58Q8R3Q6 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc58Q8R3Q6 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc58Q8R3Q6 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc58Q8R3Q6 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc58Q8R3Q6 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc58Q8R3Q6 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc58Q8R3Q6 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc58Q8R3Q6 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc58Q8R3Q6 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc58Q8R3Q6 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc58Q8R3Q6 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Ccdc58Q8R3Q6 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc58Q8R3Q6 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc58Q8R3Q6 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc58Q8R3Q6 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc58Q8R3Q6 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Ccdc58Q8R3Q6 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc58Q8R3Q6 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Ccdc58Q8R3Q6 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Ccdc58Q8R3Q6 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc58Q8R3Q6 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc58Q8R3Q6 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc58Q8R3Q6 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc58Q8R3Q6 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc58Q8R3Q6 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc58Q8R3Q6 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc58Q8R3Q6 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc58Q8R3Q6 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc58Q8R3Q6 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc58Q8R3Q6 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc58Q8R3Q6 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc58Q8R3Q6 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc58Q8R3Q6 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc58Q8R3Q6 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc58Q8R3Q6 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc58Q8R3Q6 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc58Q8R3Q6 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc58Q8R3Q6 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc58Q8R3Q6 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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