Protein–RNA interactions for Protein: Q8R3B7

Brd8, Bromodomain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd8Q8R3B7 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Brd8Q8R3B7 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Brd8Q8R3B7 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Brd8Q8R3B7 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Brd8Q8R3B7 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Brd8Q8R3B7 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Brd8Q8R3B7 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Brd8Q8R3B7 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Brd8Q8R3B7 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Brd8Q8R3B7 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Brd8Q8R3B7 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Brd8Q8R3B7 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Brd8Q8R3B7 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Brd8Q8R3B7 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Brd8Q8R3B7 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Brd8Q8R3B7 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Brd8Q8R3B7 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Brd8Q8R3B7 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Brd8Q8R3B7 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Brd8Q8R3B7 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Brd8Q8R3B7 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Brd8Q8R3B7 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Brd8Q8R3B7 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Brd8Q8R3B7 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Brd8Q8R3B7 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Brd8Q8R3B7 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Brd8Q8R3B7 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Brd8Q8R3B7 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Brd8Q8R3B7 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Brd8Q8R3B7 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Brd8Q8R3B7 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Brd8Q8R3B7 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Brd8Q8R3B7 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Brd8Q8R3B7 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Brd8Q8R3B7 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Brd8Q8R3B7 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Brd8Q8R3B7 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Brd8Q8R3B7 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Brd8Q8R3B7 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Brd8Q8R3B7 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Brd8Q8R3B7 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Brd8Q8R3B7 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Brd8Q8R3B7 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Brd8Q8R3B7 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Brd8Q8R3B7 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Brd8Q8R3B7 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Brd8Q8R3B7 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Brd8Q8R3B7 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Brd8Q8R3B7 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Brd8Q8R3B7 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Brd8Q8R3B7 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Brd8Q8R3B7 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Brd8Q8R3B7 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Brd8Q8R3B7 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Brd8Q8R3B7 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Brd8Q8R3B7 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Brd8Q8R3B7 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Brd8Q8R3B7 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Brd8Q8R3B7 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Brd8Q8R3B7 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Brd8Q8R3B7 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Brd8Q8R3B7 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Brd8Q8R3B7 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Brd8Q8R3B7 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Brd8Q8R3B7 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Brd8Q8R3B7 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Brd8Q8R3B7 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Brd8Q8R3B7 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Brd8Q8R3B7 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Brd8Q8R3B7 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Brd8Q8R3B7 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Brd8Q8R3B7 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Brd8Q8R3B7 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Brd8Q8R3B7 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Brd8Q8R3B7 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Brd8Q8R3B7 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Brd8Q8R3B7 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Brd8Q8R3B7 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Brd8Q8R3B7 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Brd8Q8R3B7 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Brd8Q8R3B7 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Brd8Q8R3B7 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Brd8Q8R3B7 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Brd8Q8R3B7 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Brd8Q8R3B7 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Brd8Q8R3B7 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Brd8Q8R3B7 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Brd8Q8R3B7 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Brd8Q8R3B7 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Brd8Q8R3B7 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Brd8Q8R3B7 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Brd8Q8R3B7 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Brd8Q8R3B7 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Brd8Q8R3B7 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Brd8Q8R3B7 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Brd8Q8R3B7 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Brd8Q8R3B7 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Brd8Q8R3B7 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Brd8Q8R3B7 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Brd8Q8R3B7 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms