Protein–RNA interactions for Protein: Q8R344

Ccdc12, Coiled-coil domain-containing protein 12, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc12Q8R344 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc12Q8R344 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc12Q8R344 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc12Q8R344 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc12Q8R344 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc12Q8R344 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc12Q8R344 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc12Q8R344 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc12Q8R344 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc12Q8R344 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc12Q8R344 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc12Q8R344 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc12Q8R344 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc12Q8R344 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc12Q8R344 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc12Q8R344 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc12Q8R344 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc12Q8R344 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc12Q8R344 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc12Q8R344 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc12Q8R344 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc12Q8R344 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc12Q8R344 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc12Q8R344 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc12Q8R344 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc12Q8R344 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc12Q8R344 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc12Q8R344 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc12Q8R344 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc12Q8R344 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc12Q8R344 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc12Q8R344 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc12Q8R344 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc12Q8R344 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc12Q8R344 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc12Q8R344 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc12Q8R344 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc12Q8R344 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc12Q8R344 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc12Q8R344 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc12Q8R344 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc12Q8R344 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc12Q8R344 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc12Q8R344 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc12Q8R344 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc12Q8R344 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc12Q8R344 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc12Q8R344 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc12Q8R344 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc12Q8R344 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc12Q8R344 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc12Q8R344 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc12Q8R344 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc12Q8R344 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc12Q8R344 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc12Q8R344 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc12Q8R344 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc12Q8R344 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc12Q8R344 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc12Q8R344 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc12Q8R344 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc12Q8R344 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc12Q8R344 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc12Q8R344 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc12Q8R344 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc12Q8R344 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc12Q8R344 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc12Q8R344 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc12Q8R344 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc12Q8R344 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc12Q8R344 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc12Q8R344 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc12Q8R344 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc12Q8R344 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc12Q8R344 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc12Q8R344 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc12Q8R344 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc12Q8R344 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc12Q8R344 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc12Q8R344 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc12Q8R344 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc12Q8R344 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc12Q8R344 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc12Q8R344 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc12Q8R344 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc12Q8R344 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc12Q8R344 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc12Q8R344 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc12Q8R344 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc12Q8R344 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc12Q8R344 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc12Q8R344 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc12Q8R344 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc12Q8R344 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc12Q8R344 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc12Q8R344 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc12Q8R344 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc12Q8R344 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc12Q8R344 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc12Q8R344 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms