Protein–RNA interactions for Protein: Q8R281

Vmn1r200, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r200Q8R281 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vmn1r200Q8R281 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vmn1r200Q8R281 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vmn1r200Q8R281 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vmn1r200Q8R281 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Vmn1r200Q8R281 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Vmn1r200Q8R281 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vmn1r200Q8R281 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vmn1r200Q8R281 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vmn1r200Q8R281 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Vmn1r200Q8R281 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vmn1r200Q8R281 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Vmn1r200Q8R281 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Vmn1r200Q8R281 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Vmn1r200Q8R281 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Vmn1r200Q8R281 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Vmn1r200Q8R281 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Vmn1r200Q8R281 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Vmn1r200Q8R281 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Vmn1r200Q8R281 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Vmn1r200Q8R281 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r200Q8R281 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r200Q8R281 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r200Q8R281 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r200Q8R281 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r200Q8R281 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r200Q8R281 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r200Q8R281 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r200Q8R281 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r200Q8R281 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r200Q8R281 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r200Q8R281 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r200Q8R281 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r200Q8R281 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r200Q8R281 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r200Q8R281 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r200Q8R281 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r200Q8R281 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r200Q8R281 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r200Q8R281 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r200Q8R281 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r200Q8R281 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r200Q8R281 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r200Q8R281 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r200Q8R281 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r200Q8R281 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r200Q8R281 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r200Q8R281 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r200Q8R281 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r200Q8R281 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r200Q8R281 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r200Q8R281 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r200Q8R281 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r200Q8R281 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r200Q8R281 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r200Q8R281 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r200Q8R281 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r200Q8R281 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r200Q8R281 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r200Q8R281 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r200Q8R281 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r200Q8R281 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r200Q8R281 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r200Q8R281 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r200Q8R281 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r200Q8R281 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r200Q8R281 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r200Q8R281 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r200Q8R281 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r200Q8R281 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r200Q8R281 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r200Q8R281 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r200Q8R281 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r200Q8R281 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r200Q8R281 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r200Q8R281 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r200Q8R281 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r200Q8R281 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r200Q8R281 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r200Q8R281 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r200Q8R281 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r200Q8R281 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r200Q8R281 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r200Q8R281 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r200Q8R281 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r200Q8R281 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r200Q8R281 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r200Q8R281 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r200Q8R281 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r200Q8R281 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r200Q8R281 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r200Q8R281 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r200Q8R281 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r200Q8R281 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r200Q8R281 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r200Q8R281 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r200Q8R281 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r200Q8R281 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r200Q8R281 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r200Q8R281 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms