Protein–RNA interactions for Protein: Q8R1W8

Impg1, Interphotoreceptor matrix proteoglycan 1, mousemouse

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Length 798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Impg1Q8R1W8 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Impg1Q8R1W8 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Impg1Q8R1W8 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Impg1Q8R1W8 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Impg1Q8R1W8 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Impg1Q8R1W8 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Impg1Q8R1W8 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Impg1Q8R1W8 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Impg1Q8R1W8 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Impg1Q8R1W8 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Impg1Q8R1W8 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Impg1Q8R1W8 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Impg1Q8R1W8 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Impg1Q8R1W8 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Impg1Q8R1W8 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Impg1Q8R1W8 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Impg1Q8R1W8 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Impg1Q8R1W8 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Impg1Q8R1W8 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Impg1Q8R1W8 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Impg1Q8R1W8 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Impg1Q8R1W8 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Impg1Q8R1W8 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Impg1Q8R1W8 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Impg1Q8R1W8 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Impg1Q8R1W8 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Impg1Q8R1W8 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Impg1Q8R1W8 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Impg1Q8R1W8 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Impg1Q8R1W8 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Impg1Q8R1W8 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Impg1Q8R1W8 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Impg1Q8R1W8 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Impg1Q8R1W8 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Impg1Q8R1W8 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Impg1Q8R1W8 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Impg1Q8R1W8 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Impg1Q8R1W8 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Impg1Q8R1W8 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Impg1Q8R1W8 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Impg1Q8R1W8 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Impg1Q8R1W8 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Impg1Q8R1W8 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Impg1Q8R1W8 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Impg1Q8R1W8 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Impg1Q8R1W8 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Impg1Q8R1W8 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Impg1Q8R1W8 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Impg1Q8R1W8 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Impg1Q8R1W8 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Impg1Q8R1W8 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Impg1Q8R1W8 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Impg1Q8R1W8 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Impg1Q8R1W8 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Impg1Q8R1W8 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Impg1Q8R1W8 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Impg1Q8R1W8 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Impg1Q8R1W8 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Impg1Q8R1W8 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Impg1Q8R1W8 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Impg1Q8R1W8 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Impg1Q8R1W8 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Impg1Q8R1W8 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Impg1Q8R1W8 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Impg1Q8R1W8 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Impg1Q8R1W8 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Impg1Q8R1W8 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Impg1Q8R1W8 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Impg1Q8R1W8 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Impg1Q8R1W8 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Impg1Q8R1W8 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Impg1Q8R1W8 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Impg1Q8R1W8 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Impg1Q8R1W8 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Impg1Q8R1W8 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Impg1Q8R1W8 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Impg1Q8R1W8 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Impg1Q8R1W8 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Impg1Q8R1W8 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Impg1Q8R1W8 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Impg1Q8R1W8 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Impg1Q8R1W8 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Impg1Q8R1W8 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Impg1Q8R1W8 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Impg1Q8R1W8 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Impg1Q8R1W8 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Impg1Q8R1W8 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Impg1Q8R1W8 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Impg1Q8R1W8 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Impg1Q8R1W8 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Impg1Q8R1W8 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Impg1Q8R1W8 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Impg1Q8R1W8 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Impg1Q8R1W8 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Impg1Q8R1W8 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Impg1Q8R1W8 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Impg1Q8R1W8 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Impg1Q8R1W8 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Impg1Q8R1W8 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Impg1Q8R1W8 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
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