Protein–RNA interactions for Protein: Q8K389

Cdk5rap2, CDK5 regulatory subunit-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk5rap2Q8K389 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Cdk5rap2Q8K389 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Cdk5rap2Q8K389 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Cdk5rap2Q8K389 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cdk5rap2Q8K389 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Cdk5rap2Q8K389 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Cdk5rap2Q8K389 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cdk5rap2Q8K389 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cdk5rap2Q8K389 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cdk5rap2Q8K389 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cdk5rap2Q8K389 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cdk5rap2Q8K389 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cdk5rap2Q8K389 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cdk5rap2Q8K389 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cdk5rap2Q8K389 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cdk5rap2Q8K389 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cdk5rap2Q8K389 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cdk5rap2Q8K389 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cdk5rap2Q8K389 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cdk5rap2Q8K389 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cdk5rap2Q8K389 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cdk5rap2Q8K389 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cdk5rap2Q8K389 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Cdk5rap2Q8K389 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cdk5rap2Q8K389 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cdk5rap2Q8K389 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Cdk5rap2Q8K389 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cdk5rap2Q8K389 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Cdk5rap2Q8K389 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Cdk5rap2Q8K389 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Cdk5rap2Q8K389 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cdk5rap2Q8K389 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cdk5rap2Q8K389 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cdk5rap2Q8K389 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cdk5rap2Q8K389 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cdk5rap2Q8K389 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cdk5rap2Q8K389 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cdk5rap2Q8K389 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cdk5rap2Q8K389 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cdk5rap2Q8K389 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cdk5rap2Q8K389 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cdk5rap2Q8K389 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cdk5rap2Q8K389 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cdk5rap2Q8K389 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cdk5rap2Q8K389 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cdk5rap2Q8K389 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cdk5rap2Q8K389 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cdk5rap2Q8K389 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Cdk5rap2Q8K389 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cdk5rap2Q8K389 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cdk5rap2Q8K389 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cdk5rap2Q8K389 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cdk5rap2Q8K389 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cdk5rap2Q8K389 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cdk5rap2Q8K389 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cdk5rap2Q8K389 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cdk5rap2Q8K389 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cdk5rap2Q8K389 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cdk5rap2Q8K389 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cdk5rap2Q8K389 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cdk5rap2Q8K389 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cdk5rap2Q8K389 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cdk5rap2Q8K389 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cdk5rap2Q8K389 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cdk5rap2Q8K389 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cdk5rap2Q8K389 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Cdk5rap2Q8K389 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cdk5rap2Q8K389 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cdk5rap2Q8K389 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cdk5rap2Q8K389 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cdk5rap2Q8K389 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cdk5rap2Q8K389 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cdk5rap2Q8K389 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cdk5rap2Q8K389 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cdk5rap2Q8K389 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cdk5rap2Q8K389 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cdk5rap2Q8K389 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cdk5rap2Q8K389 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cdk5rap2Q8K389 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cdk5rap2Q8K389 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cdk5rap2Q8K389 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cdk5rap2Q8K389 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cdk5rap2Q8K389 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cdk5rap2Q8K389 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cdk5rap2Q8K389 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cdk5rap2Q8K389 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cdk5rap2Q8K389 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cdk5rap2Q8K389 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cdk5rap2Q8K389 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cdk5rap2Q8K389 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cdk5rap2Q8K389 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cdk5rap2Q8K389 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cdk5rap2Q8K389 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cdk5rap2Q8K389 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cdk5rap2Q8K389 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cdk5rap2Q8K389 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cdk5rap2Q8K389 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Cdk5rap2Q8K389 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Cdk5rap2Q8K389 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cdk5rap2Q8K389 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms