Protein–RNA interactions for Protein: Q8K330

Ssh3, Protein phosphatase Slingshot homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssh3Q8K330 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ssh3Q8K330 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ssh3Q8K330 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ssh3Q8K330 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ssh3Q8K330 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ssh3Q8K330 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ssh3Q8K330 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ssh3Q8K330 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ssh3Q8K330 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ssh3Q8K330 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ssh3Q8K330 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ssh3Q8K330 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ssh3Q8K330 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ssh3Q8K330 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ssh3Q8K330 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ssh3Q8K330 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ssh3Q8K330 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ssh3Q8K330 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ssh3Q8K330 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ssh3Q8K330 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ssh3Q8K330 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ssh3Q8K330 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ssh3Q8K330 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ssh3Q8K330 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ssh3Q8K330 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ssh3Q8K330 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ssh3Q8K330 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ssh3Q8K330 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ssh3Q8K330 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ssh3Q8K330 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ssh3Q8K330 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ssh3Q8K330 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ssh3Q8K330 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ssh3Q8K330 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ssh3Q8K330 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ssh3Q8K330 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ssh3Q8K330 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ssh3Q8K330 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ssh3Q8K330 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ssh3Q8K330 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ssh3Q8K330 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ssh3Q8K330 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ssh3Q8K330 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ssh3Q8K330 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ssh3Q8K330 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ssh3Q8K330 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ssh3Q8K330 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ssh3Q8K330 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ssh3Q8K330 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ssh3Q8K330 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ssh3Q8K330 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ssh3Q8K330 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ssh3Q8K330 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ssh3Q8K330 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ssh3Q8K330 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ssh3Q8K330 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ssh3Q8K330 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ssh3Q8K330 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ssh3Q8K330 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ssh3Q8K330 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ssh3Q8K330 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ssh3Q8K330 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ssh3Q8K330 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ssh3Q8K330 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ssh3Q8K330 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ssh3Q8K330 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ssh3Q8K330 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ssh3Q8K330 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ssh3Q8K330 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ssh3Q8K330 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ssh3Q8K330 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ssh3Q8K330 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ssh3Q8K330 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ssh3Q8K330 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ssh3Q8K330 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ssh3Q8K330 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ssh3Q8K330 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ssh3Q8K330 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ssh3Q8K330 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ssh3Q8K330 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ssh3Q8K330 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ssh3Q8K330 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Ssh3Q8K330 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ssh3Q8K330 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ssh3Q8K330 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ssh3Q8K330 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ssh3Q8K330 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ssh3Q8K330 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ssh3Q8K330 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ssh3Q8K330 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ssh3Q8K330 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ssh3Q8K330 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ssh3Q8K330 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ssh3Q8K330 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ssh3Q8K330 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ssh3Q8K330 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ssh3Q8K330 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ssh3Q8K330 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ssh3Q8K330 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ssh3Q8K330 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms