Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Z2

Prpf39, Pre-mRNA-processing factor 39, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf39Q8K2Z2 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prpf39Q8K2Z2 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prpf39Q8K2Z2 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prpf39Q8K2Z2 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prpf39Q8K2Z2 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prpf39Q8K2Z2 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prpf39Q8K2Z2 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prpf39Q8K2Z2 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prpf39Q8K2Z2 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prpf39Q8K2Z2 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Prpf39Q8K2Z2 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prpf39Q8K2Z2 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prpf39Q8K2Z2 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prpf39Q8K2Z2 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prpf39Q8K2Z2 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prpf39Q8K2Z2 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prpf39Q8K2Z2 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prpf39Q8K2Z2 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prpf39Q8K2Z2 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prpf39Q8K2Z2 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prpf39Q8K2Z2 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prpf39Q8K2Z2 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prpf39Q8K2Z2 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prpf39Q8K2Z2 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prpf39Q8K2Z2 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prpf39Q8K2Z2 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prpf39Q8K2Z2 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prpf39Q8K2Z2 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prpf39Q8K2Z2 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Prpf39Q8K2Z2 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prpf39Q8K2Z2 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prpf39Q8K2Z2 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prpf39Q8K2Z2 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prpf39Q8K2Z2 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prpf39Q8K2Z2 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prpf39Q8K2Z2 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prpf39Q8K2Z2 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prpf39Q8K2Z2 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prpf39Q8K2Z2 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Prpf39Q8K2Z2 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Prpf39Q8K2Z2 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Prpf39Q8K2Z2 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Prpf39Q8K2Z2 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Prpf39Q8K2Z2 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Prpf39Q8K2Z2 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Prpf39Q8K2Z2 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Prpf39Q8K2Z2 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Prpf39Q8K2Z2 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Prpf39Q8K2Z2 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Prpf39Q8K2Z2 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Prpf39Q8K2Z2 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Prpf39Q8K2Z2 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Prpf39Q8K2Z2 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Prpf39Q8K2Z2 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Prpf39Q8K2Z2 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Prpf39Q8K2Z2 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Prpf39Q8K2Z2 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Prpf39Q8K2Z2 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Prpf39Q8K2Z2 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Prpf39Q8K2Z2 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Prpf39Q8K2Z2 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Prpf39Q8K2Z2 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Prpf39Q8K2Z2 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Prpf39Q8K2Z2 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Prpf39Q8K2Z2 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Prpf39Q8K2Z2 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Prpf39Q8K2Z2 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Prpf39Q8K2Z2 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Prpf39Q8K2Z2 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Prpf39Q8K2Z2 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Prpf39Q8K2Z2 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Prpf39Q8K2Z2 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Prpf39Q8K2Z2 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Prpf39Q8K2Z2 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Prpf39Q8K2Z2 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Prpf39Q8K2Z2 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Prpf39Q8K2Z2 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Prpf39Q8K2Z2 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Prpf39Q8K2Z2 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Prpf39Q8K2Z2 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Prpf39Q8K2Z2 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Prpf39Q8K2Z2 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Prpf39Q8K2Z2 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Prpf39Q8K2Z2 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Prpf39Q8K2Z2 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Prpf39Q8K2Z2 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Prpf39Q8K2Z2 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Prpf39Q8K2Z2 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Prpf39Q8K2Z2 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Prpf39Q8K2Z2 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Prpf39Q8K2Z2 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Prpf39Q8K2Z2 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Prpf39Q8K2Z2 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Prpf39Q8K2Z2 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Prpf39Q8K2Z2 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Prpf39Q8K2Z2 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Prpf39Q8K2Z2 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Prpf39Q8K2Z2 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Prpf39Q8K2Z2 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Prpf39Q8K2Z2 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms