Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2T8

Paf1, RNA polymerase II-associated factor 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Paf1Q8K2T8 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Paf1Q8K2T8 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Paf1Q8K2T8 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Paf1Q8K2T8 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Paf1Q8K2T8 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Paf1Q8K2T8 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Paf1Q8K2T8 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Paf1Q8K2T8 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Paf1Q8K2T8 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Paf1Q8K2T8 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Paf1Q8K2T8 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Paf1Q8K2T8 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Paf1Q8K2T8 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Paf1Q8K2T8 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Paf1Q8K2T8 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Paf1Q8K2T8 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Paf1Q8K2T8 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Paf1Q8K2T8 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Paf1Q8K2T8 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Paf1Q8K2T8 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Paf1Q8K2T8 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Paf1Q8K2T8 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Paf1Q8K2T8 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Paf1Q8K2T8 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Paf1Q8K2T8 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Paf1Q8K2T8 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Paf1Q8K2T8 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Paf1Q8K2T8 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Paf1Q8K2T8 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Paf1Q8K2T8 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Paf1Q8K2T8 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Paf1Q8K2T8 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Paf1Q8K2T8 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Paf1Q8K2T8 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Paf1Q8K2T8 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Paf1Q8K2T8 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Paf1Q8K2T8 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Paf1Q8K2T8 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Paf1Q8K2T8 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Paf1Q8K2T8 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Paf1Q8K2T8 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Paf1Q8K2T8 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Paf1Q8K2T8 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Paf1Q8K2T8 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Paf1Q8K2T8 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Paf1Q8K2T8 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Paf1Q8K2T8 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Paf1Q8K2T8 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Paf1Q8K2T8 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Paf1Q8K2T8 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Paf1Q8K2T8 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Paf1Q8K2T8 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Paf1Q8K2T8 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Paf1Q8K2T8 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Paf1Q8K2T8 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Paf1Q8K2T8 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Paf1Q8K2T8 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Paf1Q8K2T8 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Paf1Q8K2T8 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Paf1Q8K2T8 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Paf1Q8K2T8 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Paf1Q8K2T8 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Paf1Q8K2T8 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Paf1Q8K2T8 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Paf1Q8K2T8 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Paf1Q8K2T8 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Paf1Q8K2T8 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Paf1Q8K2T8 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Paf1Q8K2T8 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Paf1Q8K2T8 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Paf1Q8K2T8 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Paf1Q8K2T8 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Paf1Q8K2T8 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Paf1Q8K2T8 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Paf1Q8K2T8 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Paf1Q8K2T8 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Paf1Q8K2T8 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Paf1Q8K2T8 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Paf1Q8K2T8 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Paf1Q8K2T8 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Paf1Q8K2T8 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Paf1Q8K2T8 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Paf1Q8K2T8 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Paf1Q8K2T8 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Paf1Q8K2T8 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Paf1Q8K2T8 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Paf1Q8K2T8 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Paf1Q8K2T8 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Paf1Q8K2T8 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Paf1Q8K2T8 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Paf1Q8K2T8 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Paf1Q8K2T8 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Paf1Q8K2T8 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Paf1Q8K2T8 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Paf1Q8K2T8 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Paf1Q8K2T8 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Paf1Q8K2T8 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Paf1Q8K2T8 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Paf1Q8K2T8 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Paf1Q8K2T8 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.4 ms