Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2M3

Srrd, SRR1-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrrdQ8K2M3 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SrrdQ8K2M3 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SrrdQ8K2M3 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SrrdQ8K2M3 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SrrdQ8K2M3 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SrrdQ8K2M3 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SrrdQ8K2M3 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SrrdQ8K2M3 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SrrdQ8K2M3 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SrrdQ8K2M3 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
SrrdQ8K2M3 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SrrdQ8K2M3 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SrrdQ8K2M3 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
SrrdQ8K2M3 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SrrdQ8K2M3 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SrrdQ8K2M3 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SrrdQ8K2M3 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SrrdQ8K2M3 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SrrdQ8K2M3 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SrrdQ8K2M3 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
SrrdQ8K2M3 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SrrdQ8K2M3 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SrrdQ8K2M3 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SrrdQ8K2M3 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SrrdQ8K2M3 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SrrdQ8K2M3 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SrrdQ8K2M3 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
SrrdQ8K2M3 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SrrdQ8K2M3 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SrrdQ8K2M3 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SrrdQ8K2M3 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SrrdQ8K2M3 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
SrrdQ8K2M3 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SrrdQ8K2M3 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SrrdQ8K2M3 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SrrdQ8K2M3 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SrrdQ8K2M3 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SrrdQ8K2M3 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SrrdQ8K2M3 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SrrdQ8K2M3 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SrrdQ8K2M3 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
SrrdQ8K2M3 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SrrdQ8K2M3 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SrrdQ8K2M3 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SrrdQ8K2M3 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SrrdQ8K2M3 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SrrdQ8K2M3 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SrrdQ8K2M3 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SrrdQ8K2M3 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SrrdQ8K2M3 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SrrdQ8K2M3 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SrrdQ8K2M3 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SrrdQ8K2M3 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SrrdQ8K2M3 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SrrdQ8K2M3 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SrrdQ8K2M3 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SrrdQ8K2M3 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
SrrdQ8K2M3 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SrrdQ8K2M3 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SrrdQ8K2M3 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SrrdQ8K2M3 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SrrdQ8K2M3 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SrrdQ8K2M3 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SrrdQ8K2M3 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SrrdQ8K2M3 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SrrdQ8K2M3 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SrrdQ8K2M3 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SrrdQ8K2M3 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SrrdQ8K2M3 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SrrdQ8K2M3 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SrrdQ8K2M3 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SrrdQ8K2M3 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SrrdQ8K2M3 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SrrdQ8K2M3 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
SrrdQ8K2M3 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SrrdQ8K2M3 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SrrdQ8K2M3 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SrrdQ8K2M3 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SrrdQ8K2M3 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SrrdQ8K2M3 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
SrrdQ8K2M3 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SrrdQ8K2M3 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SrrdQ8K2M3 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SrrdQ8K2M3 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SrrdQ8K2M3 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SrrdQ8K2M3 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SrrdQ8K2M3 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SrrdQ8K2M3 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SrrdQ8K2M3 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SrrdQ8K2M3 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SrrdQ8K2M3 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.03■□□□□ -0
SrrdQ8K2M3 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SrrdQ8K2M3 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SrrdQ8K2M3 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SrrdQ8K2M3 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SrrdQ8K2M3 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SrrdQ8K2M3 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SrrdQ8K2M3 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SrrdQ8K2M3 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SrrdQ8K2M3 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms