Protein–RNA interactions for Protein: Q8K285

Fcho1, F-BAR domain only protein 1, mousemouse

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Length 873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcho1Q8K285 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fcho1Q8K285 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fcho1Q8K285 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fcho1Q8K285 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fcho1Q8K285 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fcho1Q8K285 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fcho1Q8K285 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fcho1Q8K285 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fcho1Q8K285 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fcho1Q8K285 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fcho1Q8K285 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fcho1Q8K285 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fcho1Q8K285 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fcho1Q8K285 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fcho1Q8K285 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fcho1Q8K285 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fcho1Q8K285 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fcho1Q8K285 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fcho1Q8K285 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fcho1Q8K285 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fcho1Q8K285 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Fcho1Q8K285 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fcho1Q8K285 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fcho1Q8K285 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fcho1Q8K285 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fcho1Q8K285 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fcho1Q8K285 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fcho1Q8K285 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fcho1Q8K285 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fcho1Q8K285 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Fcho1Q8K285 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fcho1Q8K285 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fcho1Q8K285 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fcho1Q8K285 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fcho1Q8K285 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fcho1Q8K285 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fcho1Q8K285 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Fcho1Q8K285 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fcho1Q8K285 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fcho1Q8K285 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fcho1Q8K285 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fcho1Q8K285 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fcho1Q8K285 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fcho1Q8K285 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fcho1Q8K285 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fcho1Q8K285 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fcho1Q8K285 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fcho1Q8K285 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fcho1Q8K285 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fcho1Q8K285 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Fcho1Q8K285 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fcho1Q8K285 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fcho1Q8K285 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fcho1Q8K285 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fcho1Q8K285 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fcho1Q8K285 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fcho1Q8K285 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fcho1Q8K285 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fcho1Q8K285 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fcho1Q8K285 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fcho1Q8K285 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fcho1Q8K285 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fcho1Q8K285 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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Fcho1Q8K285 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fcho1Q8K285 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fcho1Q8K285 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
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Fcho1Q8K285 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fcho1Q8K285 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fcho1Q8K285 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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Fcho1Q8K285 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fcho1Q8K285 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fcho1Q8K285 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
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Fcho1Q8K285 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Fcho1Q8K285 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fcho1Q8K285 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fcho1Q8K285 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fcho1Q8K285 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fcho1Q8K285 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fcho1Q8K285 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fcho1Q8K285 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fcho1Q8K285 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fcho1Q8K285 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fcho1Q8K285 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fcho1Q8K285 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fcho1Q8K285 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fcho1Q8K285 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fcho1Q8K285 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fcho1Q8K285 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fcho1Q8K285 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fcho1Q8K285 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fcho1Q8K285 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fcho1Q8K285 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fcho1Q8K285 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
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