Protein–RNA interactions for Protein: Q8K205

Pop1, Processing of 1, ribonuclease P/MRP family, (S. cerevisiae), mousemouse

Predictions only

Length 1,045 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pop1Q8K205 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pop1Q8K205 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pop1Q8K205 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pop1Q8K205 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pop1Q8K205 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pop1Q8K205 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pop1Q8K205 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pop1Q8K205 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pop1Q8K205 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pop1Q8K205 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pop1Q8K205 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pop1Q8K205 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pop1Q8K205 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pop1Q8K205 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pop1Q8K205 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pop1Q8K205 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pop1Q8K205 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pop1Q8K205 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pop1Q8K205 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pop1Q8K205 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pop1Q8K205 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pop1Q8K205 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pop1Q8K205 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pop1Q8K205 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pop1Q8K205 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pop1Q8K205 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pop1Q8K205 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pop1Q8K205 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pop1Q8K205 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pop1Q8K205 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pop1Q8K205 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pop1Q8K205 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pop1Q8K205 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pop1Q8K205 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pop1Q8K205 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pop1Q8K205 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pop1Q8K205 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pop1Q8K205 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pop1Q8K205 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pop1Q8K205 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pop1Q8K205 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pop1Q8K205 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pop1Q8K205 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pop1Q8K205 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pop1Q8K205 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pop1Q8K205 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pop1Q8K205 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pop1Q8K205 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pop1Q8K205 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pop1Q8K205 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pop1Q8K205 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pop1Q8K205 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pop1Q8K205 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pop1Q8K205 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pop1Q8K205 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pop1Q8K205 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pop1Q8K205 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pop1Q8K205 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Pop1Q8K205 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pop1Q8K205 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pop1Q8K205 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pop1Q8K205 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pop1Q8K205 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pop1Q8K205 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pop1Q8K205 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pop1Q8K205 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pop1Q8K205 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pop1Q8K205 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pop1Q8K205 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pop1Q8K205 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pop1Q8K205 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pop1Q8K205 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pop1Q8K205 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pop1Q8K205 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pop1Q8K205 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pop1Q8K205 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pop1Q8K205 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pop1Q8K205 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pop1Q8K205 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pop1Q8K205 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pop1Q8K205 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pop1Q8K205 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pop1Q8K205 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pop1Q8K205 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pop1Q8K205 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pop1Q8K205 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pop1Q8K205 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pop1Q8K205 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pop1Q8K205 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pop1Q8K205 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pop1Q8K205 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pop1Q8K205 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pop1Q8K205 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pop1Q8K205 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pop1Q8K205 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pop1Q8K205 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pop1Q8K205 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pop1Q8K205 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pop1Q8K205 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pop1Q8K205 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms