Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1Y2

Prkd3, Serine/threonine-protein kinase D3, mousemouse

Predictions only

Length 889 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkd3Q8K1Y2 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prkd3Q8K1Y2 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prkd3Q8K1Y2 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prkd3Q8K1Y2 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prkd3Q8K1Y2 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Prkd3Q8K1Y2 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prkd3Q8K1Y2 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prkd3Q8K1Y2 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prkd3Q8K1Y2 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prkd3Q8K1Y2 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prkd3Q8K1Y2 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prkd3Q8K1Y2 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prkd3Q8K1Y2 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prkd3Q8K1Y2 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prkd3Q8K1Y2 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prkd3Q8K1Y2 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prkd3Q8K1Y2 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prkd3Q8K1Y2 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prkd3Q8K1Y2 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Prkd3Q8K1Y2 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prkd3Q8K1Y2 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prkd3Q8K1Y2 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prkd3Q8K1Y2 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prkd3Q8K1Y2 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prkd3Q8K1Y2 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prkd3Q8K1Y2 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prkd3Q8K1Y2 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prkd3Q8K1Y2 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prkd3Q8K1Y2 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prkd3Q8K1Y2 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prkd3Q8K1Y2 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prkd3Q8K1Y2 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prkd3Q8K1Y2 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prkd3Q8K1Y2 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prkd3Q8K1Y2 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prkd3Q8K1Y2 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prkd3Q8K1Y2 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prkd3Q8K1Y2 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prkd3Q8K1Y2 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prkd3Q8K1Y2 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Prkd3Q8K1Y2 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prkd3Q8K1Y2 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Prkd3Q8K1Y2 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prkd3Q8K1Y2 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prkd3Q8K1Y2 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prkd3Q8K1Y2 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prkd3Q8K1Y2 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prkd3Q8K1Y2 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prkd3Q8K1Y2 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prkd3Q8K1Y2 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Prkd3Q8K1Y2 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prkd3Q8K1Y2 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prkd3Q8K1Y2 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prkd3Q8K1Y2 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prkd3Q8K1Y2 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prkd3Q8K1Y2 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prkd3Q8K1Y2 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prkd3Q8K1Y2 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prkd3Q8K1Y2 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prkd3Q8K1Y2 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prkd3Q8K1Y2 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prkd3Q8K1Y2 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prkd3Q8K1Y2 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prkd3Q8K1Y2 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prkd3Q8K1Y2 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prkd3Q8K1Y2 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prkd3Q8K1Y2 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prkd3Q8K1Y2 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prkd3Q8K1Y2 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prkd3Q8K1Y2 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prkd3Q8K1Y2 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prkd3Q8K1Y2 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prkd3Q8K1Y2 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Prkd3Q8K1Y2 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Prkd3Q8K1Y2 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Prkd3Q8K1Y2 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Prkd3Q8K1Y2 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Prkd3Q8K1Y2 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Prkd3Q8K1Y2 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Prkd3Q8K1Y2 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Prkd3Q8K1Y2 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Prkd3Q8K1Y2 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Prkd3Q8K1Y2 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prkd3Q8K1Y2 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prkd3Q8K1Y2 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prkd3Q8K1Y2 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prkd3Q8K1Y2 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prkd3Q8K1Y2 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prkd3Q8K1Y2 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prkd3Q8K1Y2 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prkd3Q8K1Y2 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prkd3Q8K1Y2 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prkd3Q8K1Y2 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prkd3Q8K1Y2 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prkd3Q8K1Y2 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prkd3Q8K1Y2 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prkd3Q8K1Y2 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prkd3Q8K1Y2 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prkd3Q8K1Y2 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prkd3Q8K1Y2 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms