Protein–RNA interactions for Protein: Q8K158

Cnppd1, Protein CNPPD1, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnppd1Q8K158 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cnppd1Q8K158 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cnppd1Q8K158 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cnppd1Q8K158 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cnppd1Q8K158 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cnppd1Q8K158 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cnppd1Q8K158 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cnppd1Q8K158 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cnppd1Q8K158 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cnppd1Q8K158 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cnppd1Q8K158 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cnppd1Q8K158 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cnppd1Q8K158 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cnppd1Q8K158 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cnppd1Q8K158 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cnppd1Q8K158 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cnppd1Q8K158 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cnppd1Q8K158 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cnppd1Q8K158 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cnppd1Q8K158 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cnppd1Q8K158 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Cnppd1Q8K158 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cnppd1Q8K158 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cnppd1Q8K158 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cnppd1Q8K158 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cnppd1Q8K158 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cnppd1Q8K158 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cnppd1Q8K158 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cnppd1Q8K158 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cnppd1Q8K158 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cnppd1Q8K158 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cnppd1Q8K158 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cnppd1Q8K158 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cnppd1Q8K158 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cnppd1Q8K158 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cnppd1Q8K158 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cnppd1Q8K158 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cnppd1Q8K158 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cnppd1Q8K158 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Cnppd1Q8K158 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cnppd1Q8K158 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cnppd1Q8K158 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Cnppd1Q8K158 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cnppd1Q8K158 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cnppd1Q8K158 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cnppd1Q8K158 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cnppd1Q8K158 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cnppd1Q8K158 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cnppd1Q8K158 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cnppd1Q8K158 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cnppd1Q8K158 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cnppd1Q8K158 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cnppd1Q8K158 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Cnppd1Q8K158 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cnppd1Q8K158 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cnppd1Q8K158 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cnppd1Q8K158 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cnppd1Q8K158 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cnppd1Q8K158 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cnppd1Q8K158 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cnppd1Q8K158 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cnppd1Q8K158 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cnppd1Q8K158 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Cnppd1Q8K158 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cnppd1Q8K158 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cnppd1Q8K158 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cnppd1Q8K158 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cnppd1Q8K158 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cnppd1Q8K158 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cnppd1Q8K158 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Cnppd1Q8K158 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Cnppd1Q8K158 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cnppd1Q8K158 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Cnppd1Q8K158 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cnppd1Q8K158 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cnppd1Q8K158 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cnppd1Q8K158 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cnppd1Q8K158 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Cnppd1Q8K158 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cnppd1Q8K158 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cnppd1Q8K158 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cnppd1Q8K158 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cnppd1Q8K158 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cnppd1Q8K158 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cnppd1Q8K158 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cnppd1Q8K158 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cnppd1Q8K158 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cnppd1Q8K158 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cnppd1Q8K158 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cnppd1Q8K158 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cnppd1Q8K158 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cnppd1Q8K158 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Cnppd1Q8K158 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cnppd1Q8K158 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cnppd1Q8K158 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cnppd1Q8K158 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cnppd1Q8K158 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cnppd1Q8K158 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cnppd1Q8K158 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cnppd1Q8K158 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.8 ms