Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZW5

Sh2d5, SH2 domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh2d5Q8JZW5 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sh2d5Q8JZW5 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sh2d5Q8JZW5 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sh2d5Q8JZW5 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sh2d5Q8JZW5 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sh2d5Q8JZW5 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sh2d5Q8JZW5 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sh2d5Q8JZW5 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sh2d5Q8JZW5 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sh2d5Q8JZW5 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sh2d5Q8JZW5 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sh2d5Q8JZW5 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sh2d5Q8JZW5 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sh2d5Q8JZW5 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sh2d5Q8JZW5 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sh2d5Q8JZW5 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sh2d5Q8JZW5 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sh2d5Q8JZW5 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sh2d5Q8JZW5 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sh2d5Q8JZW5 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Sh2d5Q8JZW5 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sh2d5Q8JZW5 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sh2d5Q8JZW5 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sh2d5Q8JZW5 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sh2d5Q8JZW5 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sh2d5Q8JZW5 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sh2d5Q8JZW5 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Sh2d5Q8JZW5 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sh2d5Q8JZW5 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sh2d5Q8JZW5 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sh2d5Q8JZW5 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Sh2d5Q8JZW5 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Sh2d5Q8JZW5 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sh2d5Q8JZW5 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sh2d5Q8JZW5 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sh2d5Q8JZW5 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sh2d5Q8JZW5 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Sh2d5Q8JZW5 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sh2d5Q8JZW5 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sh2d5Q8JZW5 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sh2d5Q8JZW5 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sh2d5Q8JZW5 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sh2d5Q8JZW5 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sh2d5Q8JZW5 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sh2d5Q8JZW5 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sh2d5Q8JZW5 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sh2d5Q8JZW5 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sh2d5Q8JZW5 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sh2d5Q8JZW5 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sh2d5Q8JZW5 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sh2d5Q8JZW5 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sh2d5Q8JZW5 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sh2d5Q8JZW5 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sh2d5Q8JZW5 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sh2d5Q8JZW5 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sh2d5Q8JZW5 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sh2d5Q8JZW5 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sh2d5Q8JZW5 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sh2d5Q8JZW5 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sh2d5Q8JZW5 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sh2d5Q8JZW5 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sh2d5Q8JZW5 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sh2d5Q8JZW5 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sh2d5Q8JZW5 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sh2d5Q8JZW5 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sh2d5Q8JZW5 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sh2d5Q8JZW5 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sh2d5Q8JZW5 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sh2d5Q8JZW5 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sh2d5Q8JZW5 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Sh2d5Q8JZW5 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Sh2d5Q8JZW5 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Sh2d5Q8JZW5 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sh2d5Q8JZW5 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sh2d5Q8JZW5 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sh2d5Q8JZW5 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sh2d5Q8JZW5 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sh2d5Q8JZW5 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sh2d5Q8JZW5 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sh2d5Q8JZW5 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sh2d5Q8JZW5 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sh2d5Q8JZW5 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sh2d5Q8JZW5 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sh2d5Q8JZW5 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sh2d5Q8JZW5 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sh2d5Q8JZW5 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sh2d5Q8JZW5 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sh2d5Q8JZW5 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sh2d5Q8JZW5 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sh2d5Q8JZW5 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sh2d5Q8JZW5 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sh2d5Q8JZW5 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sh2d5Q8JZW5 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sh2d5Q8JZW5 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sh2d5Q8JZW5 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sh2d5Q8JZW5 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sh2d5Q8JZW5 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Sh2d5Q8JZW5 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Sh2d5Q8JZW5 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Sh2d5Q8JZW5 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms